More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1525 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4122  CoA-binding domain protein  67.09 
 
 
719 aa  964    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3116  hypothetical protein  80.08 
 
 
713 aa  1184    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0277399  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4362  hypothetical protein  79.89 
 
 
709 aa  1154    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138782  normal  0.0457098 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8714  CoA-binding domain protein  89.47 
 
 
722 aa  1313    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1525  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
722 aa  1456    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193132  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  37.34 
 
 
689 aa  422  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  35.01 
 
 
688 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1969  CoA-binding domain protein  34.43 
 
 
680 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2327  CoA-binding domain-containing protein  35.78 
 
 
707 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1703  CoA-binding domain-containing protein  33.86 
 
 
680 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0914  CoA-binding domain-containing protein  34.91 
 
 
687 aa  403  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.216851  hitchhiker  0.00000000145434 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  34.48 
 
 
687 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  33.13 
 
 
707 aa  386  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1620  CoA-binding domain-containing protein  34.78 
 
 
694 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0696581 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  31.99 
 
 
705 aa  380  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1910  CoA-binding domain protein  35 
 
 
676 aa  372  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236564  normal  0.164304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  41.52 
 
 
704 aa  345  2e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1246  CoA-binding domain-containing protein  34.69 
 
 
753 aa  340  7e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  41.14 
 
 
696 aa  336  7e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  40.04 
 
 
714 aa  335  2e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  39.95 
 
 
711 aa  331  3e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  40.62 
 
 
698 aa  320  7e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  38.85 
 
 
703 aa  319  1e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  38.63 
 
 
702 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  38.63 
 
 
702 aa  317  4e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  36.56 
 
 
706 aa  316  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  40.22 
 
 
698 aa  309  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  39.43 
 
 
697 aa  307  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  40.64 
 
 
696 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  39.36 
 
 
699 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  43.06 
 
 
669 aa  303  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  37.97 
 
 
929 aa  299  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  33.99 
 
 
701 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  34.55 
 
 
698 aa  287  5e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  37.22 
 
 
700 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  36.7 
 
 
911 aa  277  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  34.93 
 
 
706 aa  277  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  34.94 
 
 
892 aa  276  8e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  36.28 
 
 
918 aa  276  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  32.97 
 
 
905 aa  274  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  35.32 
 
 
915 aa  272  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0319  CoA-binding domain protein  33.63 
 
 
464 aa  273  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  33.59 
 
 
883 aa  270  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  33.19 
 
 
712 aa  268  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  34.08 
 
 
912 aa  266  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  36.2 
 
 
920 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.93 
 
 
892 aa  266  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.95 
 
 
660 aa  265  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.33 
 
 
699 aa  265  3e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  35.21 
 
 
711 aa  263  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3442  CoA-binding domain protein  27.82 
 
 
710 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  35.48 
 
 
709 aa  262  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1093  CoA-binding domain-containing protein  35.36 
 
 
477 aa  263  1e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  34.47 
 
 
921 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  35.94 
 
 
699 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0336  CoA-binding domain-containing protein  35.88 
 
 
508 aa  259  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  35.99 
 
 
698 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1854  CoA-binding domain-containing protein  33.4 
 
 
472 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  36.61 
 
 
704 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0484  CoA-binding domain-containing protein  33.98 
 
 
461 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.833675  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  32.27 
 
 
660 aa  253  7e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
889 aa  252  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  32.68 
 
 
897 aa  251  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0162  CoA-binding domain-containing protein  36.55 
 
 
516 aa  250  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166188  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  33.7 
 
 
900 aa  249  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  32.95 
 
 
895 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4996  CoA-binding domain-containing protein  31.72 
 
 
705 aa  248  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0586  CoA-binding domain-containing protein  27.43 
 
 
705 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  32.59 
 
 
893 aa  246  9e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  32.53 
 
 
695 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1804  CoA-binding domain-containing protein  34.99 
 
 
461 aa  244  3e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.688194  normal  0.0833486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  32.1 
 
 
697 aa  243  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  34.24 
 
 
907 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  32.88 
 
 
707 aa  242  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  33.03 
 
 
913 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1635  CoA-binding domain-containing protein  33.91 
 
 
461 aa  238  3e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  35.06 
 
 
911 aa  238  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 
907 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.77 
 
 
903 aa  235  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  32.54 
 
 
703 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1589  CoA-binding domain-containing protein  36.97 
 
 
451 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
907 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  33.19 
 
 
728 aa  229  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  38.59 
 
 
904 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  37.95 
 
 
887 aa  226  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  35.35 
 
 
727 aa  226  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  31.36 
 
 
697 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
693 aa  221  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0978  CoA-binding domain-containing protein  33.06 
 
 
375 aa  221  5e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00209366  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  33.11 
 
 
886 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2897  CoA-binding domain-containing protein  31.73 
 
 
451 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  31.86 
 
 
750 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
896 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 
926 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
899 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  28.86 
 
 
900 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  37.06 
 
 
899 aa  217  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  34.74 
 
 
881 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
976 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  35.01 
 
 
700 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>