260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2209 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2209  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  30.11 
 
 		 502 aa  62  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  30.39 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  30.15 
 
 		 855 aa  58.9  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  30.22 
 
 		 523 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  30.22 
 
 		 528 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  28.06 
 
 		 523 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  26.53 
 
 		 491 aa  55.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 579 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  27.27 
 
 		 471 aa  53.9  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.1 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.473362  hitchhiker  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  28.87 
 
 		 524 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  28.57 
 
 		 537 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1248  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.41 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.490271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  29.08 
 
 		 520 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.23 
 
 		 337 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  28.78 
 
 		 496 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  28.78 
 
 		 501 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  29.5 
 
 		 516 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.77 
 
 		 366 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  28.78 
 
 		 503 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  28.78 
 
 		 503 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  27.08 
 
 		 467 aa  52  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  31.29 
 
 		 506 aa  52  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  27.46 
 
 		 529 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  31.43 
 
 		 509 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  29.65 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3670  serine endoprotease  27.94 
 
 		 369 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  28.28 
 
 		 497 aa  51.2  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1036  serine protease  29.61 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000475095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  30 
 
 		 508 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  26.54 
 
 		 469 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  31.43 
 
 		 528 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3612  serine endoprotease  28.47 
 
 		 356 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  28.26 
 
 		 496 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  27.94 
 
 		 527 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2772  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.11 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643545  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  27.81 
 
 		 505 aa  51.2  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0810  2-alkenal reductase  28.57 
 
 		 487 aa  50.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.810469 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3709  serine endoprotease  28.47 
 
 		 356 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.650789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  26.06 
 
 		 379 aa  50.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3540  serine endoprotease  28.47 
 
 		 356 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0189154  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2025  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.99 
 
 		 375 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.591638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3541  serine endoprotease  28.47 
 
 		 356 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  28.36 
 
 		 468 aa  50.1  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2880  periplasmic serine protease DegS  30.32 
 
 		 368 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0120636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3647  serine endoprotease  28.47 
 
 		 356 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0741  periplasmic serine protease DegS  28.31 
 
 		 360 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.905633  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  27.34 
 
 		 526 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2185  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.06 
 
 		 384 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.523435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  31.21 
 
 		 527 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  26.45 
 
 		 552 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03095  serine endoprotease, periplasmic  28.47 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0471  periplasmic serine protease DegS  28.47 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.183239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3424  serine endoprotease  28.47 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03046  hypothetical protein  28.47 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3531  serine endoprotease  28.47 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00943485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4552  serine endoprotease  28.47 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0248117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3541  serine endoprotease  28.47 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.360038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3718  serine endoprotease  28.47 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  27.46 
 
 		 360 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  27.46 
 
 		 360 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  27.46 
 
 		 360 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  27.46 
 
 		 360 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0918  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.95 
 
 		 271 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000713648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_906  serine protease, DegP/HtrA family  28.95 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000453115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  29.45 
 
 		 517 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1037  serine protease  30.97 
 
 		 373 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0643787  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  26.95 
 
 		 513 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  29.71 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  25.17 
 
 		 471 aa  48.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0384  trypsin-like serine protease  29.17 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368801  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  25.47 
 
 		 476 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  27.27 
 
 		 461 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  28.06 
 
 		 508 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  30.19 
 
 		 501 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  27.34 
 
 		 528 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  27.34 
 
 		 508 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3074  protease DegS  29.75 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.940129  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  29.71 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  26.95 
 
 		 513 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3943  protease DegS  27.86 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  28.57 
 
 		 471 aa  47.4  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  26.24 
 
 		 495 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  26.17 
 
 		 481 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  26.17 
 
 		 481 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  26.83 
 
 		 477 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  26.83 
 
 		 477 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.45 
 
 		 569 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1260  hypothetical protein  28.71 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  26.17 
 
 		 481 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  24.43 
 
 		 381 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  34.04 
 
 		 576 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  27.86 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0675  DegS serine peptidase  27.86 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  30.5 
 
 		 527 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0689  DegS serine peptidase  26.67 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  hitchhiker  0.000493421 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  39.62 
 
 		 395 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  26.76 
 
 		 374 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>