106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0998 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
303 aa  630  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  56.81 
 
 
315 aa  347  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 
295 aa  331  8e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 
292 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 
292 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 
289 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  39.23 
 
 
289 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  26.43 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  26.09 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  24.05 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  25.32 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  22.35 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  24.05 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  24.25 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  25.29 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  23.95 
 
 
267 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  24.71 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  24.14 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  22.26 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  24.14 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  23.57 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  24.42 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  23.22 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
290 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  22.63 
 
 
269 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  22.26 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  21.97 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  27.23 
 
 
270 aa  63.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  22.05 
 
 
267 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  22.57 
 
 
275 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
271 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  22.57 
 
 
275 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 
267 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  22.26 
 
 
275 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  22.26 
 
 
275 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  22.26 
 
 
275 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  22.26 
 
 
275 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  21.17 
 
 
301 aa  62.4  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  24.34 
 
 
320 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  23.19 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  23.57 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  22.93 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 
308 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  21.92 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
300 aa  58.9  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  21.8 
 
 
281 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
290 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  22.39 
 
 
281 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  22.39 
 
 
281 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  22.39 
 
 
281 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  21.89 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  24.25 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  21.8 
 
 
281 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  21.8 
 
 
281 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.87 
 
 
456 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  24.87 
 
 
294 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  21.64 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0606  alpha/beta fold family hydrolase  39.06 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.332573  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  21.97 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
296 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0446  triacylglycerol lipase, putative  39.29 
 
 
262 aa  49.7  0.00007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00963592  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  22.68 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  23.74 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
296 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  23.35 
 
 
289 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  24.04 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  24.04 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
251 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  24.04 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  24.04 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  21.38 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  22.62 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.12 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  24.04 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  21.07 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30500  predicted protein  20.57 
 
 
390 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.363686 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>