More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2183 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  69.93 
 
 		 585 aa  726    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  69.57 
 
 		 585 aa  722    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  100 
 
 		 563 aa  1127    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  57.94 
 
 		 575 aa  600  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  59.32 
 
 		 573 aa  585  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  57.71 
 
 		 566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  57.71 
 
 		 566 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  54.92 
 
 		 580 aa  568  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  55.08 
 
 		 585 aa  566  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  50.67 
 
 		 567 aa  477  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  48.7 
 
 		 578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  49.55 
 
 		 575 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  49.46 
 
 		 578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  48.39 
 
 		 559 aa  448  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  42.65 
 
 		 558 aa  435  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  46.54 
 
 		 566 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  52.22 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  43.68 
 
 		 570 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  46.29 
 
 		 521 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  45.65 
 
 		 520 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  47.82 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  48.76 
 
 		 522 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  49.17 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  44.23 
 
 		 599 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  44.23 
 
 		 599 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.23 
 
 		 571 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  40.6 
 
 		 565 aa  411  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  47.84 
 
 		 518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  43.88 
 
 		 599 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  47.18 
 
 		 515 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  46.06 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  51.03 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  51.03 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  42.4 
 
 		 871 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  51.03 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  51.03 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.84 
 
 		 568 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.13 
 
 		 568 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  50.8 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  42.4 
 
 		 568 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.13 
 
 		 568 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  51.03 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  43.79 
 
 		 552 aa  404  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  51.03 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  51.03 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  41.52 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  44.1 
 
 		 603 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  51.49 
 
 		 499 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  44.18 
 
 		 503 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  51.03 
 
 		 499 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  51.03 
 
 		 499 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  50.34 
 
 		 515 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  51.03 
 
 		 499 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  45.89 
 
 		 550 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  42.34 
 
 		 610 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.4 
 
 		 553 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.98 
 
 		 568 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  50.57 
 
 		 498 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  45.88 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  45.7 
 
 		 520 aa  399  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.68 
 
 		 553 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  50.8 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  41.89 
 
 		 570 aa  399  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  42.05 
 
 		 558 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  51.03 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  40.04 
 
 		 571 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.7 
 
 		 520 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.35 
 
 		 568 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3085  type II secretion system protein E  47.92 
 
 		 560 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.6 
 
 		 568 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  40.45 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  43.27 
 
 		 499 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  48.48 
 
 		 500 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.93 
 
 		 568 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.55 
 
 		 568 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  44.38 
 
 		 544 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  45.92 
 
 		 498 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.8 
 
 		 568 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.61 
 
 		 564 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  43.05 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  46.82 
 
 		 524 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  45.1 
 
 		 489 aa  391  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  48.23 
 
 		 477 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.27 
 
 		 563 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  45.98 
 
 		 497 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  51.36 
 
 		 468 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  42.32 
 
 		 553 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  45.98 
 
 		 497 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  45.91 
 
 		 522 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  43.88 
 
 		 541 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  50.64 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  41.65 
 
 		 555 aa  389  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0142  general secretory pathway protein E  46.17 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.7 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  45.98 
 
 		 497 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  48.83 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  49.07 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  44.74 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  46.19 
 
 		 497 aa  385  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  44.06 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>