More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3357 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3357  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  254  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2288  response regulator receiver protein  66.94 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0512  response regulator receiver protein  66.12 
 
 		 129 aa  169  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00633837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1747  response regulator receiver domain-containing protein  59.5 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.244381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1147  response regulator receiver protein  60.32 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3115  response regulator receiver protein  60.32 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1231  response regulator  57.02 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1566  response regulator receiver protein  55.37 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3999  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 567 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2451  response regulator  29.91 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1978  serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 		 473 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3268  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 483 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 1002 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2314  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.08 
 
 		 1313 aa  50.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0636  response regulator receiver protein  32.53 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2009  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 463 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1899  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  34.12 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 759 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 758 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  27.1 
 
 		 912 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  38.33 
 
 		 544 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1869  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.71 
 
 		 464 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0809  putative diguanylate phosphodiesterase  31.11 
 
 		 411 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.21 
 
 		 1514 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  30.12 
 
 		 401 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 268 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.21 
 
 		 1514 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  29.41 
 
 		 474 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 878 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2529  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00604151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5047  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 387 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1615  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 256 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 931 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  32.05 
 
 		 192 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3175  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.67 
 
 		 250 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0969  response regulator receiver  31.63 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.28 
 
 		 227 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  34.94 
 
 		 226 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  29.63 
 
 		 737 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1086  response regulator receiver protein  30.12 
 
 		 256 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1766  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 203 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00488071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  37.5 
 
 		 300 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_166  DNA-binding response regulator  36.51 
 
 		 226 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  48.89 
 
 		 787 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 842 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  26.42 
 
 		 231 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 		 1415 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.94 
 
 		 225 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0125  Histidine kinase  31.15 
 
 		 615 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  31.76 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1988  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1954  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.29 
 
 		 464 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4152  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 480 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.038607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3879  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, fis family protein  33.33 
 
 		 460 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.82 
 
 		 1152 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  28.09 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  27.36 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0879  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.94 
 
 		 466 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  33.71 
 
 		 266 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  35.23 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2492  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 452 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0114408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2585  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.68 
 
 		 449 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  37.5 
 
 		 300 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 		 911 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.14 
 
 		 941 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 826 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4525  two component Fis family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 238 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2039  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 476 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2403  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 467 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 347 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 469 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3891  two component Fis family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 232 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.569436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0516  two component Fis family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 223 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0663038 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1045 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3222  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.29 
 
 		 447 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0905113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  26.8 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.94 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3778  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 460 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.916933  hitchhiker  0.00524382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1904  two component transcriptional regulator  38.37 
 
 		 226 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00970528  hitchhiker  0.0000356769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2074  two component transcriptional regulator  38.37 
 
 		 226 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00164535  hitchhiker  0.00140528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4735  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 594 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3240  two component transcriptional regulator, Fis family  32.94 
 
 		 232 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1391  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  30.48 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00446889  normal  0.206531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  41.18 
 
 		 353 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0058  two component transcriptional regulator  33.75 
 
 		 221 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551146  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1278  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 452 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.902353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  32.18 
 
 		 381 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4356  response regulator receiver  30.48 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00220083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 280 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4098  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.47 
 
 		 219 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2633  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.38 
 
 		 467 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3751  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  31.4 
 
 		 441 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  30.23 
 
 		 246 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2025  cyclic-di-GMP regulatory protein  28.09 
 
 		 390 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100945  normal  0.0489408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>