More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2639 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  100 
 
 		 349 aa  712    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  63.22 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  52.92 
 
 		 341 aa  360  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  51.18 
 
 		 342 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  52.07 
 
 		 342 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  50.15 
 
 		 346 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  53.11 
 
 		 342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  60.5 
 
 		 246 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  60.5 
 
 		 246 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  33.44 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  33.02 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  32.27 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  32.69 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 265 aa  132  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  30.9 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  53.45 
 
 		 240 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  35.4 
 
 		 217 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  32.85 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  27.49 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  54.17 
 
 		 202 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  29.34 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  49.55 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  34.96 
 
 		 208 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  53.57 
 
 		 181 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  42.45 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  46.61 
 
 		 170 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 424 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  40.57 
 
 		 210 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  29.8 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  48.18 
 
 		 162 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  33.97 
 
 		 266 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  41.5 
 
 		 210 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  31.86 
 
 		 216 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  31.56 
 
 		 208 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 183 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  29.32 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  39.46 
 
 		 169 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  45.11 
 
 		 222 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 224 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  40.44 
 
 		 267 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  46.22 
 
 		 191 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  45.61 
 
 		 221 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  43.7 
 
 		 190 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 193 aa  102  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  43.7 
 
 		 190 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  43.7 
 
 		 190 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  37.06 
 
 		 226 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  46.02 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 223 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  43.7 
 
 		 147 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  43.7 
 
 		 147 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 223 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 223 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  44.74 
 
 		 218 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  44.74 
 
 		 234 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  44.74 
 
 		 234 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  44.74 
 
 		 234 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  44.74 
 
 		 218 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 221 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  45.61 
 
 		 223 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  44.74 
 
 		 218 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  44.74 
 
 		 218 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 188 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  44.74 
 
 		 224 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  44.74 
 
 		 234 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  42.86 
 
 		 188 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  37.57 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  42.48 
 
 		 226 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 223 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 192 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 202 aa  99.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 192 aa  99.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  28.53 
 
 		 295 aa  99.8  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  38.4 
 
 		 177 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  43.86 
 
 		 228 aa  99.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  38.4 
 
 		 198 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  42.61 
 
 		 333 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  42.02 
 
 		 189 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  44.54 
 
 		 191 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  41.82 
 
 		 162 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>