159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1442 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  100 
 
 
195 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  60.53 
 
 
205 aa  239  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  55.5 
 
 
199 aa  209  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  53.12 
 
 
197 aa  204  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  54.21 
 
 
198 aa  204  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  52.82 
 
 
197 aa  204  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  52.33 
 
 
199 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  53.16 
 
 
197 aa  202  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  50.78 
 
 
198 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  51.56 
 
 
197 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  52.33 
 
 
199 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  51.56 
 
 
197 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  51.56 
 
 
197 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  51.81 
 
 
197 aa  197  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  47.72 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  49.47 
 
 
200 aa  195  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  47.89 
 
 
200 aa  194  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  48.22 
 
 
198 aa  194  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  50.79 
 
 
203 aa  191  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  50 
 
 
204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  48.15 
 
 
203 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  48.68 
 
 
203 aa  185  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  49.46 
 
 
189 aa  185  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  47.94 
 
 
199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  47.34 
 
 
199 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  46.91 
 
 
199 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  45.31 
 
 
203 aa  177  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  51.61 
 
 
214 aa  171  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  43.98 
 
 
199 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  48.42 
 
 
233 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  43.68 
 
 
192 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  47.89 
 
 
209 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  46.6 
 
 
209 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  41.44 
 
 
190 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  42.7 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  42.29 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  36.76 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  41.76 
 
 
201 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  40.74 
 
 
200 aa  122  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  39.46 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  41.67 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  36.76 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  42.46 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  41.62 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  41.62 
 
 
201 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  41.08 
 
 
201 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  39.29 
 
 
205 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  41.9 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  41.9 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  40.54 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  40.54 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  41.9 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  41.9 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  41.9 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  41.9 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  41.9 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  40.54 
 
 
201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  35.57 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  44.94 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  41.08 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  39.46 
 
 
205 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  39.46 
 
 
197 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  40.56 
 
 
151 aa  104  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  36.36 
 
 
203 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  34.41 
 
 
199 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  40.88 
 
 
214 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  34.05 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  34.05 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  34.25 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  35 
 
 
194 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  35.29 
 
 
321 aa  94  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  34.71 
 
 
321 aa  93.2  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  33.7 
 
 
191 aa  91.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  33.7 
 
 
199 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  32.97 
 
 
315 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  35.95 
 
 
195 aa  85.5  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  34.15 
 
 
187 aa  84.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  32.58 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  28.65 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  32.75 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  28.89 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  28.3 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.87 
 
 
330 aa  68.2  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  30.38 
 
 
163 aa  62.4  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  23.53 
 
 
177 aa  57  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.05 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  26.56 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  25.39 
 
 
173 aa  55.1  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.52 
 
 
168 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  28.28 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.47 
 
 
180 aa  51.2  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  26.58 
 
 
167 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  30.67 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.88 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  26.62 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  27.27 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  27.17 
 
 
183 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  53.85 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  44.9 
 
 
170 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>