More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0318 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 452 aa  900    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  30.7 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  33.49 
 
 		 521 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  27.45 
 
 		 710 aa  89.7  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  30.68 
 
 		 515 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.62 
 
 		 872 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  25.1 
 
 		 734 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  32.93 
 
 		 870 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  31.05 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.18 
 
 		 576 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  30.38 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  29.93 
 
 		 309 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  25.07 
 
 		 706 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  30.22 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  30.33 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  30.67 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.54 
 
 		 862 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  28.47 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  30.17 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  28.81 
 
 		 886 aa  80.9  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 567 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  32.04 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 949 aa  79.7  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  28.25 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  28.99 
 
 		 351 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 776 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1191 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  32.2 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  25.71 
 
 		 727 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  32.55 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  27.85 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  27.85 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  32.7 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  29.28 
 
 		 961 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  26.13 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  26.13 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  32.27 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  32.13 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  28.24 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  25.26 
 
 		 866 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  29.63 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  31.74 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  35.5 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  29.22 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  25.42 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  30.42 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  29.11 
 
 		 872 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  31.49 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  29.26 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  29.26 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  32.95 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  30.15 
 
 		 312 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  26.1 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  32.2 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  26.07 
 
 		 600 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  25.13 
 
 		 881 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  27.43 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  25.53 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  20.66 
 
 		 976 aa  70.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.48 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  27.99 
 
 		 846 aa  70.9  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  31.68 
 
 		 877 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  30.21 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  27.16 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  30.29 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  29.36 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  31.68 
 
 		 880 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  33.97 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  26.87 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  26.87 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  27.08 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  27.08 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  27.08 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  28.07 
 
 		 355 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30.28 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  30.29 
 
 		 262 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  27.94 
 
 		 300 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.87 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 844 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.4 
 
 		 14916 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  25.88 
 
 		 356 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  24.03 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 		 825 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 		 825 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  25.86 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  29.75 
 
 		 825 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  29.66 
 
 		 214 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  27.84 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  29.51 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  26.59 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  27.06 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  27.35 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 		 825 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 		 825 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  31.19 
 
 		 215 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  29.75 
 
 		 862 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  25.86 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  30.05 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>