More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2882 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
178 aa  357  7e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  65.73 
 
 
181 aa  240  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  62.36 
 
 
181 aa  236  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  62.5 
 
 
181 aa  225  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.43 
 
 
179 aa  217  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.7 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.44 
 
 
180 aa  184  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.47 
 
 
181 aa  111  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  33.95 
 
 
192 aa  101  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.9 
 
 
182 aa  100  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.37 
 
 
180 aa  100  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.18 
 
 
182 aa  97.8  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  31.64 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
180 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
180 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
180 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
180 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
180 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.4 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.5 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  31.82 
 
 
179 aa  90.9  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  29.78 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.14 
 
 
180 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.95 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.95 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  27.49 
 
 
179 aa  87.4  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
190 aa  87.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.95 
 
 
180 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  31.4 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
190 aa  87  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
184 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.71 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.14 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.83 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  28.32 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.66 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  27.43 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.66 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.11 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  27.06 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  30 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.95 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.18 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.53 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.28 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  28.98 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.93 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  29.89 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  26.14 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  30.68 
 
 
209 aa  79  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.28 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  29.94 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  30.51 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.37 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  29.17 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  34.35 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.98 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3062  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.6 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  29.83 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.05 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.16 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.79 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.21 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0064  ATP synthase F1 subunit delta  29.55 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17830  ATP synthase F1, delta subunit  36.84 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.58 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  28.57 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  29.76 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.59 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  28.41 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.17 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>