More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2720 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  71.36 
 
 		 213 aa  325  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  66.04 
 
 		 226 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  65.73 
 
 		 213 aa  298  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  60.56 
 
 		 215 aa  284  5.999999999999999e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  60.09 
 
 		 213 aa  284  5.999999999999999e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  57.55 
 
 		 218 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  39.09 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  36.82 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  35.35 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.51 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  34.63 
 
 		 354 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  32.38 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  32.83 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  37.09 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.99 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  33.16 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06840  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12840)  36.42 
 
 		 254 aa  101  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39505  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  33.84 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.65 
 
 		 346 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  32.64 
 
 		 235 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  35.67 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.05 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 		 209 aa  98.6  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  34.91 
 
 		 450 aa  98.2  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.71 
 
 		 201 aa  98.2  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  32.73 
 
 		 467 aa  95.9  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 		 249 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  31.1 
 
 		 237 aa  94.7  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  33.51 
 
 		 229 aa  94.7  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.54 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  32.68 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  28.91 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  31.96 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31656  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.87 
 
 		 255 aa  92.4  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.976065  normal  0.697857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  32.09 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  30.29 
 
 		 346 aa  92  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  32.39 
 
 		 444 aa  91.3  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.2 
 
 		 256 aa  91.3  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  28.71 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  30.2 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  32.32 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  32.06 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 470 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  30.69 
 
 		 345 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 		 470 aa  89.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.74 
 
 		 272 aa  89  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 266 aa  89  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2260  beta-lactamase domain-containing protein  35.08 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  30.04 
 
 		 258 aa  88.6  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 471 aa  88.6  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 		 464 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 470 aa  88.2  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.18 
 
 		 260 aa  88.2  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.89 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1750  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.43 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022513  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.52 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.97 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 344 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  33.15 
 
 		 382 aa  87.8  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 		 459 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.86 
 
 		 361 aa  87  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.92 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  28.37 
 
 		 346 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.66 
 
 		 472 aa  86.3  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  28.87 
 
 		 426 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 		 471 aa  86.3  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  28.99 
 
 		 426 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 466 aa  85.5  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  30.19 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 244 aa  85.1  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.5 
 
 		 260 aa  85.1  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 238 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  34.5 
 
 		 257 aa  84.7  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02510  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  36.67 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  31.12 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  38.37 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  38.37 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>