More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1870 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  80.5 
 
 		 400 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  86.58 
 
 		 395 aa  719    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  88.61 
 
 		 395 aa  736    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  86.25 
 
 		 400 aa  728    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  80.25 
 
 		 400 aa  667    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 400 aa  822    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  88.5 
 
 		 400 aa  734    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5351  NADH dehydrogenase (quinone)  60.69 
 
 		 406 aa  491  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3733  NADH dehydrogenase (quinone)  59.06 
 
 		 405 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150314  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0512  NADH dehydrogenase I, subunit D  57.63 
 
 		 392 aa  472  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0661  hypothetical protein  56.58 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  47.12 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  48.13 
 
 		 379 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  49.73 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  48.13 
 
 		 379 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  49.19 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.13 
 
 		 367 aa  358  9e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  48.4 
 
 		 367 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  48.66 
 
 		 367 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  49.73 
 
 		 367 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  47.04 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.14 
 
 		 369 aa  355  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  47.04 
 
 		 366 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  47.04 
 
 		 366 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  47.04 
 
 		 366 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  47.04 
 
 		 366 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  47.04 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  47.04 
 
 		 366 aa  353  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  47.31 
 
 		 366 aa  352  7e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  46.77 
 
 		 366 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  46.77 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  46.77 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.7 
 
 		 390 aa  346  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1329  NADH dehydrogenase (quinone)  45.37 
 
 		 416 aa  346  4e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.09 
 
 		 389 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  45.36 
 
 		 381 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.09 
 
 		 389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.95 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  46.17 
 
 		 374 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  45.91 
 
 		 374 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3253  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  46 
 
 		 560 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.95 
 
 		 390 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.09 
 
 		 400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  45.16 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.92 
 
 		 401 aa  333  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.24 
 
 		 381 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  43.18 
 
 		 390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  43.85 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.08 
 
 		 426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  45.7 
 
 		 370 aa  326  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.5 
 
 		 358 aa  325  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.55 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.83 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  45.6 
 
 		 554 aa  323  3e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  45.21 
 
 		 370 aa  322  9.000000000000001e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.28 
 
 		 422 aa  322  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1919  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  45.41 
 
 		 560 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  43.59 
 
 		 393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1115  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44 
 
 		 552 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.95 
 
 		 411 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.86 
 
 		 415 aa  320  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1172  NADH dehydrogenase subunit D  42.75 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.78 
 
 		 390 aa  318  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  43.37 
 
 		 396 aa  318  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  41.59 
 
 		 417 aa  318  7.999999999999999e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.72 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  41.93 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 388 aa  317  3e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  42.29 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  42.96 
 
 		 402 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0704  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  45 
 
 		 559 aa  316  6e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.81 
 
 		 392 aa  315  8e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  43.11 
 
 		 396 aa  315  9e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  43.11 
 
 		 396 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  42.96 
 
 		 401 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0746  NADH dehydrogenase (quinone)  45.01 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  44.16 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.67 
 
 		 383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  43.04 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  40.96 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  41.45 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  42.41 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  41.45 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.41 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  41.44 
 
 		 409 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  42.6 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  41.31 
 
 		 418 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  41.19 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  41.21 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2218  NADH dehydrogenase subunit D  43.11 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.714071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.53 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  40.96 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  40.96 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3834  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.56 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.78 
 
 		 417 aa  309  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  43.2 
 
 		 371 aa  309  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  42.01 
 
 		 416 aa  309  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  40.96 
 
 		 417 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>