More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1751 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  100 
 
 
272 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  83.09 
 
 
272 aa  487  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  77.57 
 
 
272 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  73.06 
 
 
272 aa  423  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  73.72 
 
 
285 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  67.88 
 
 
273 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  40.21 
 
 
326 aa  198  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  39.65 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  36.71 
 
 
308 aa  181  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  38.11 
 
 
318 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  38.6 
 
 
316 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  34.97 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  33.92 
 
 
280 aa  158  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  34.15 
 
 
266 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  35.27 
 
 
323 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  34.15 
 
 
279 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  31.67 
 
 
308 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  34.17 
 
 
266 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  33.45 
 
 
279 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  34.18 
 
 
268 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  30.48 
 
 
292 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  32.06 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  32.06 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  32.06 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  33.22 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  32.01 
 
 
316 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  35.2 
 
 
326 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  33.11 
 
 
308 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  32.54 
 
 
295 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  34.43 
 
 
268 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  31.12 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  32.38 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  34.09 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  31.96 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  33.8 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  33.11 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  31.85 
 
 
305 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  31.85 
 
 
305 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  30.63 
 
 
279 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  31.47 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  32.91 
 
 
345 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  33.71 
 
 
269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  31.51 
 
 
305 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  29.96 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  32.18 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  32.77 
 
 
292 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  32.77 
 
 
291 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  32.6 
 
 
274 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  31.83 
 
 
281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
350 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  33.09 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
340 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  31.49 
 
 
280 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  31.6 
 
 
300 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  31.47 
 
 
279 aa  131  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  29.87 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  30.87 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  32.27 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  33.79 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  32.34 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  33.45 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  32.43 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  30.11 
 
 
273 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  31.97 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  32.09 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  30.82 
 
 
291 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  32.44 
 
 
299 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  32.21 
 
 
300 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  32.21 
 
 
300 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  32.85 
 
 
263 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  29.51 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  30.35 
 
 
344 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  33.11 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  31.29 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  32.36 
 
 
276 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  30.67 
 
 
352 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  32.43 
 
 
293 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  31.4 
 
 
319 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  29.39 
 
 
361 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  32.71 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  31.37 
 
 
278 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  32.35 
 
 
276 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  29.39 
 
 
366 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  29.39 
 
 
367 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  30.67 
 
 
352 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  31.79 
 
 
330 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  32.27 
 
 
271 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  31.76 
 
 
296 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  30.48 
 
 
297 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  31.42 
 
 
292 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  29.82 
 
 
265 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  30.25 
 
 
314 aa  122  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  32.65 
 
 
298 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  31.32 
 
 
273 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  29.41 
 
 
310 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>