77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2974 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2974  hydrolase  100 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6497  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.49 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1975  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.5 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  35.64 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  27.12 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1444  HAD superfamily hydrolase  36.89 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000160322  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.71 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.25 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 248 aa  48.5  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  28.49 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  27.54 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  34.58 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.12 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  25.45 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  40.43 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  25.64 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  40.43 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  40.43 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  25.62 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  30.15 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3027  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.11 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00159379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  46.77 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  28.36 
 
 		 219 aa  45.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  26.96 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.59 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  41.27 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2294  HAD superfamily hydrolase  23.04 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  30.15 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  24.5 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  34 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  28.08 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0521  hypothetical protein  21.23 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.82 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  26.32 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  28.1 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  28.1 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  25.64 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  29.08 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  44.44 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.02 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  26.98 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  42.59 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  26.64 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  25.55 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.63 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  24.3 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  26.98 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  42.65 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  28.38 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.41 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  22.4 
 
 		 209 aa  42.7  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.25 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1741  HAD superfamily hydrolase  29.79 
 
 		 178 aa  42.4  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.985447  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  28 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  28.38 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  28.38 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  29.29 
 
 		 214 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.74 
 
 		 220 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  22.9 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  44.23 
 
 		 254 aa  42  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>