76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2813 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 120 aa  234  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  66.67 
 
 		 120 aa  167  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  66.67 
 
 		 120 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  65.83 
 
 		 120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  63.33 
 
 		 120 aa  151  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  63.33 
 
 		 120 aa  151  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  58.82 
 
 		 122 aa  133  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  57.14 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  57.14 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  53.91 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  56.3 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  51.3 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  47.06 
 
 		 277 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  45.38 
 
 		 230 aa  98.2  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  51.02 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  51.02 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  44.12 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  45.54 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  42.11 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  41.07 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  41.32 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  39.29 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  39.29 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  39.29 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  40.52 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  27.1 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  33.66 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  34.38 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  31.73 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  32.29 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  37.62 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  29.6 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  29.7 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2217  roadblock/LC7 domain-contain protein  28.97 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  27.5 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4094  Roadblock/LC7 family protein  29 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1137  roadblock/LC7 family protein  24.56 
 
 		 293 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  26.32 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  30.59 
 
 		 121 aa  47.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  28.87 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  23.68 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  25.64 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  27.27 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  26.73 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  25.22 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  27.19 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  27.43 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4122  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  29.2 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  27.84 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  28.33 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  24.04 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  28.71 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  26.32 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  30 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  27.84 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  27.62 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  27.18 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  26.8 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  29.59 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2155  Roadblock/LC7 family protein  25 
 
 		 125 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  25.83 
 
 		 139 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  24.14 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  25.66 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0216  roadblock/LC7 family protein  27.27 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0108  roadblock/LC7 family protein  31.78 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0102077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0254  roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0701  roadblock/LC7 family protein  30.28 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.716887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  25.66 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  25.74 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>