90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2077 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  100 
 
 		 459 aa  952    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  61.3 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  60.64 
 
 		 465 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  59.79 
 
 		 465 aa  535  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  59.65 
 
 		 481 aa  521  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  62.41 
 
 		 452 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  61.65 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  60.47 
 
 		 477 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  58.57 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  53.24 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  50.12 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  49.89 
 
 		 435 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  50.7 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  50.37 
 
 		 422 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  47.72 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  46.21 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  47.2 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  46.35 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  47.32 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 459 aa  318  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  61.05 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  31.82 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  35.09 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  34.12 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  32.77 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  29.49 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  29.17 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  31.72 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  24.05 
 
 		 222 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  28.78 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  49.09 
 
 		 80 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  49.09 
 
 		 80 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 1138 aa  53.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  24.49 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  24.49 
 
 		 471 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 170 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 552 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 174 aa  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  35.85 
 
 		 168 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 168 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3583  HNH nuclease  40 
 
 		 172 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 198 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  33.33 
 
 		 174 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  37.74 
 
 		 172 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 170 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 81 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  33.96 
 
 		 168 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  36.96 
 
 		 164 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  33.96 
 
 		 174 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 165 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  35.85 
 
 		 187 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 165 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  35.85 
 
 		 185 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  35.85 
 
 		 185 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  30.07 
 
 		 295 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  30.34 
 
 		 282 aa  47.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2301  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 186 aa  46.6  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.721918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2748  HNH nuclease  41.07 
 
 		 143 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4619  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 143 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  32.31 
 
 		 102 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  38.3 
 
 		 142 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  50 
 
 		 143 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 165 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  33.96 
 
 		 177 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  35.85 
 
 		 168 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  45.24 
 
 		 170 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4463  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 151 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 165 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  35.85 
 
 		 185 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  30.08 
 
 		 292 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  33.75 
 
 		 184 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  30.08 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  30.08 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 171 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 173 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  31.11 
 
 		 177 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  33.96 
 
 		 169 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  37.74 
 
 		 169 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 189 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  33.9 
 
 		 168 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  34.12 
 
 		 186 aa  44.3  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 174 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 315 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  29.9 
 
 		 160 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  35.42 
 
 		 189 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  32.39 
 
 		 131 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 168 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  33.96 
 
 		 165 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 197 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  38.6 
 
 		 221 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>