More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1031 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  94.2 
 
 		 431 aa  784    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  78.14 
 
 		 434 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 431 aa  877    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  64.95 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  62.85 
 
 		 428 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  64.25 
 
 		 428 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  53.35 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  53.35 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  51.9 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  52.87 
 
 		 436 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  47.39 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  51.18 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  50.24 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  48.1 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  47.43 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  47.17 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  44.47 
 
 		 430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 430 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  39.9 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 		 434 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 427 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  40.73 
 
 		 427 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  40.34 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  40.34 
 
 		 427 aa  274  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 440 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 		 428 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 		 434 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 		 436 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 433 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  41.83 
 
 		 427 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 427 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 432 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 		 428 aa  239  9e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  36.23 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  36.47 
 
 		 429 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  35.48 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 428 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 478 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  37.37 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 428 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 433 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  37.16 
 
 		 423 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  37.66 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  34.51 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  34.51 
 
 		 430 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 429 aa  209  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  34.27 
 
 		 430 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  36.47 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  35.99 
 
 		 427 aa  207  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  32.94 
 
 		 428 aa  206  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  32.94 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  33.8 
 
 		 430 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  34.19 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 		 433 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 428 aa  199  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  33.18 
 
 		 439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 442 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  31.5 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 436 aa  196  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 433 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 431 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 431 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 430 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.03 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 427 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  31.26 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 428 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0665  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 436 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 428 aa  193  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 		 439 aa  193  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 428 aa  192  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 428 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  32.32 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>