More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3860 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  100 
 
 		 219 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  87.1 
 
 		 220 aa  347  9e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  86.18 
 
 		 220 aa  342  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  77.42 
 
 		 217 aa  338  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  78.34 
 
 		 217 aa  338  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  75.58 
 
 		 218 aa  332  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  79.72 
 
 		 219 aa  321  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  78.97 
 
 		 219 aa  317  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  78.5 
 
 		 218 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  78.04 
 
 		 219 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  46.48 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  44.44 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  47.41 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  45.93 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  37.87 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  37.28 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  48.82 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  40.26 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  40.74 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  40.29 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  50.96 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  42.86 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  39.33 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  50.96 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  45.99 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  50.44 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  45.26 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  42.06 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  43.24 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  49.58 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  40.65 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  49.55 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  37.5 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  39.26 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  49.04 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  40.88 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  39.31 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  39.62 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  34.46 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  42.86 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  44.12 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  39.06 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  38.79 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  47.24 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  34.46 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  36.36 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.2 
 
 		 300 aa  68.2  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  35.61 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  49.32 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  37.88 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  38.35 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.7 
 
 		 296 aa  65.1  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  45.67 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  36.43 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 506 aa  62.8  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  47.83 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  60 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.89 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.48 
 
 		 293 aa  62  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.65 
 
 		 294 aa  62  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  47.83 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 294 aa  62  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  34.27 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  58 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.07 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.48 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.07 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.59 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.59 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  58 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  38.1 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.59 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  30.81 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  36.9 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.58 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.96 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  35.61 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.16 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.62 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  33.14 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.87 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  35.59 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.44 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  33.91 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  35.71 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  37.31 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.77 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.66 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2003  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.67 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.221022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.58 
 
 		 299 aa  58.2  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.03 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  31.79 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.31 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.64 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>