257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0198 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  64.79 
 
 		 575 aa  717    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  66.07 
 
 		 564 aa  773    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  64.77 
 
 		 567 aa  749    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  63.99 
 
 		 620 aa  683    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  63.17 
 
 		 582 aa  717    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  61.46 
 
 		 563 aa  703    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  76.2 
 
 		 564 aa  829    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  100 
 
 		 566 aa  1105    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  66.9 
 
 		 566 aa  739    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  63.73 
 
 		 574 aa  710    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  61.84 
 
 		 568 aa  708    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  68.21 
 
 		 563 aa  749    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  67.73 
 
 		 564 aa  777    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  51.56 
 
 		 611 aa  533  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  50.72 
 
 		 601 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  49.27 
 
 		 588 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  47.26 
 
 		 623 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  50.81 
 
 		 586 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  47.46 
 
 		 585 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  50.45 
 
 		 592 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  48.64 
 
 		 610 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  45.77 
 
 		 585 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  46.22 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  45.93 
 
 		 553 aa  445  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  43.43 
 
 		 568 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  44.46 
 
 		 548 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  44.46 
 
 		 548 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  44.12 
 
 		 547 aa  422  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  43.56 
 
 		 547 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  43.76 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  43.84 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  43.92 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  43.76 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  43.76 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  43.38 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  44.52 
 
 		 570 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  43.5 
 
 		 550 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  43.58 
 
 		 547 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  44.75 
 
 		 570 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  43.22 
 
 		 547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  42.88 
 
 		 547 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  43.99 
 
 		 569 aa  395  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  42.52 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  42 
 
 		 578 aa  386  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  42.65 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  43.48 
 
 		 570 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  43.06 
 
 		 570 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  40 
 
 		 590 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.47 
 
 		 538 aa  352  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  35.68 
 
 		 570 aa  299  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  33.68 
 
 		 563 aa  294  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  34.07 
 
 		 511 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  33.33 
 
 		 446 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  32.15 
 
 		 526 aa  193  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  28.99 
 
 		 534 aa  193  8e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  29.88 
 
 		 559 aa  192  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  33.88 
 
 		 548 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  31.09 
 
 		 544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  30.05 
 
 		 530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  27.81 
 
 		 553 aa  169  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  28.03 
 
 		 553 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  25.95 
 
 		 506 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  27.4 
 
 		 556 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  27.4 
 
 		 556 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  27.4 
 
 		 556 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  27.23 
 
 		 553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  30.02 
 
 		 504 aa  163  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  27.27 
 
 		 552 aa  163  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  27.44 
 
 		 552 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  26.99 
 
 		 551 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  27.78 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  27.23 
 
 		 556 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  27.78 
 
 		 552 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  27.78 
 
 		 552 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  27.78 
 
 		 552 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  27.78 
 
 		 552 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  30.94 
 
 		 494 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  27.62 
 
 		 551 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  26.37 
 
 		 551 aa  160  7e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  26.52 
 
 		 563 aa  156  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  26.52 
 
 		 563 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  25.82 
 
 		 506 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  27.08 
 
 		 553 aa  154  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  26.08 
 
 		 545 aa  153  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  25.43 
 
 		 510 aa  153  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  29.14 
 
 		 557 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  26.92 
 
 		 565 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  26.7 
 
 		 547 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  25.18 
 
 		 592 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  25.99 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  26.92 
 
 		 560 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  26.43 
 
 		 566 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  27.08 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  27.83 
 
 		 557 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  25.05 
 
 		 507 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  27.32 
 
 		 551 aa  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  26 
 
 		 576 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  28.16 
 
 		 561 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  28.09 
 
 		 558 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  28.31 
 
 		 545 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>