262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1653 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  100 
 
 		 585 aa  1147    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  76.58 
 
 		 585 aa  911    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  95.04 
 
 		 585 aa  1076    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  60.07 
 
 		 588 aa  632  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  53.29 
 
 		 611 aa  571  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  57.37 
 
 		 586 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  53.14 
 
 		 601 aa  525  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  50.72 
 
 		 568 aa  512  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  50.9 
 
 		 582 aa  510  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  49.91 
 
 		 564 aa  507  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  50.09 
 
 		 575 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  49.38 
 
 		 563 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  49.56 
 
 		 574 aa  500  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  49.46 
 
 		 564 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  50.36 
 
 		 610 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  50.92 
 
 		 620 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  47.76 
 
 		 563 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  48.39 
 
 		 566 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  46.17 
 
 		 567 aa  461  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  48.07 
 
 		 564 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  46.3 
 
 		 623 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  47.97 
 
 		 592 aa  451  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  46.22 
 
 		 566 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  44.26 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  43.48 
 
 		 547 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  43.4 
 
 		 547 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  43.38 
 
 		 550 aa  411  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  43.48 
 
 		 547 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  43.48 
 
 		 547 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  43.48 
 
 		 547 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  42.68 
 
 		 547 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  43.01 
 
 		 548 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  43.01 
 
 		 548 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  43.64 
 
 		 547 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  43.38 
 
 		 547 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  43.01 
 
 		 547 aa  405  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  42.29 
 
 		 547 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  44.89 
 
 		 553 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  43.45 
 
 		 570 aa  398  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  41.44 
 
 		 570 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  43.47 
 
 		 562 aa  395  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  40.88 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  40.51 
 
 		 570 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  39.89 
 
 		 569 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  42.12 
 
 		 568 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  44.61 
 
 		 557 aa  382  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  39.75 
 
 		 590 aa  373  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  39.42 
 
 		 578 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.72 
 
 		 538 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  33.04 
 
 		 563 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  34.22 
 
 		 570 aa  269  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  33.53 
 
 		 526 aa  233  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  32.99 
 
 		 559 aa  230  6e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  30.73 
 
 		 511 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  31.83 
 
 		 534 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  29.89 
 
 		 530 aa  203  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  29.48 
 
 		 544 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  29.8 
 
 		 446 aa  170  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  28.49 
 
 		 506 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  26.89 
 
 		 556 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  26.89 
 
 		 556 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  26.57 
 
 		 565 aa  156  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  26.89 
 
 		 556 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  26.9 
 
 		 510 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  26.57 
 
 		 560 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  25.46 
 
 		 507 aa  153  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  28.5 
 
 		 545 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  26.89 
 
 		 556 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  28.31 
 
 		 504 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  26.22 
 
 		 560 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  30.08 
 
 		 548 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  25.18 
 
 		 516 aa  151  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  25.8 
 
 		 545 aa  150  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  31.36 
 
 		 494 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  26.96 
 
 		 551 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  27.74 
 
 		 506 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  26.96 
 
 		 551 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  26.6 
 
 		 570 aa  147  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  26.78 
 
 		 551 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  27.09 
 
 		 506 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  26.78 
 
 		 551 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  27.89 
 
 		 551 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  27.85 
 
 		 564 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  27.71 
 
 		 563 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  25.48 
 
 		 553 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  26.79 
 
 		 551 aa  144  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  27.58 
 
 		 563 aa  144  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  26.32 
 
 		 560 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  25.31 
 
 		 553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  27.05 
 
 		 562 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1340  L-lactate permease  27.94 
 
 		 516 aa  141  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  25.35 
 
 		 553 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  29.15 
 
 		 566 aa  140  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  25.35 
 
 		 552 aa  140  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  25.31 
 
 		 553 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  26.07 
 
 		 561 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  25.71 
 
 		 557 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  26.61 
 
 		 566 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  25.13 
 
 		 553 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  25.26 
 
 		 552 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>