261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0373 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  100 
 
 
504 aa  974    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  46.73 
 
 
446 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  44 
 
 
548 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  45.79 
 
 
494 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  30.83 
 
 
564 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  30.98 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  33.81 
 
 
506 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  33.65 
 
 
506 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  33.1 
 
 
506 aa  194  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  30.47 
 
 
564 aa  194  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  31.17 
 
 
566 aa  190  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  29.58 
 
 
585 aa  189  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  30.6 
 
 
567 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  29.11 
 
 
574 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  30.1 
 
 
588 aa  181  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  30.02 
 
 
511 aa  180  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.16 
 
 
538 aa  180  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  29.7 
 
 
575 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  29.03 
 
 
585 aa  179  9e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  30.69 
 
 
582 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  29.35 
 
 
563 aa  178  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  28.6 
 
 
547 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  27.29 
 
 
585 aa  177  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  30.52 
 
 
566 aa  177  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  31.59 
 
 
563 aa  176  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  30.6 
 
 
562 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  32.16 
 
 
578 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  29.06 
 
 
547 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  30.28 
 
 
500 aa  174  3.9999999999999995e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  31.37 
 
 
570 aa  174  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  29.64 
 
 
568 aa  172  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  28.06 
 
 
547 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  29.53 
 
 
547 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  28.6 
 
 
547 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  28.6 
 
 
547 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  28.22 
 
 
547 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  28.83 
 
 
510 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  30.36 
 
 
507 aa  169  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  28.6 
 
 
547 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  28.6 
 
 
547 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  30.64 
 
 
570 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  28.55 
 
 
547 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  30.8 
 
 
620 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  27.87 
 
 
547 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  30.81 
 
 
569 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  27.82 
 
 
548 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  27.82 
 
 
548 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  27.32 
 
 
550 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  29.67 
 
 
611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  30.94 
 
 
570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  30.51 
 
 
570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  27.86 
 
 
590 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  28.38 
 
 
507 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  30.78 
 
 
592 aa  163  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  29.03 
 
 
551 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  27.99 
 
 
552 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  28.17 
 
 
551 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  29.89 
 
 
545 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  29.48 
 
 
553 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  28.39 
 
 
551 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  27.83 
 
 
552 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  28.17 
 
 
551 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  29.68 
 
 
568 aa  161  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  28.05 
 
 
548 aa  160  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000751768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  28.46 
 
 
576 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  31.66 
 
 
610 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  25.47 
 
 
539 aa  159  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  25.98 
 
 
545 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5545  L-lactate transport  30.4 
 
 
533 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  28.82 
 
 
543 aa  156  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  29.2 
 
 
526 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  27.58 
 
 
552 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  27.73 
 
 
553 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  27.22 
 
 
553 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  27.37 
 
 
552 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  27.37 
 
 
552 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  27.37 
 
 
552 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  27.37 
 
 
552 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  28.03 
 
 
560 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  28.39 
 
 
551 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  29.2 
 
 
586 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  27.04 
 
 
553 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  28.6 
 
 
551 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  27.78 
 
 
601 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  28.41 
 
 
551 aa  151  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  27.61 
 
 
557 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  27.64 
 
 
540 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  28.82 
 
 
551 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  28.82 
 
 
551 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  28.82 
 
 
551 aa  150  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  28.82 
 
 
551 aa  150  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  28.82 
 
 
551 aa  150  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  28.39 
 
 
562 aa  150  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  28.82 
 
 
551 aa  150  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  28.82 
 
 
551 aa  150  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  28.82 
 
 
551 aa  150  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  28.82 
 
 
551 aa  150  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  25.28 
 
 
539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  28.11 
 
 
551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  26.48 
 
 
553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>