263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1409 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  64.52 
 
 		 560 aa  689    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  67.33 
 
 		 551 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  67.51 
 
 		 551 aa  721    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  64.16 
 
 		 560 aa  687    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  66.19 
 
 		 561 aa  712    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  64.26 
 
 		 553 aa  706    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  66.18 
 
 		 556 aa  715    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  64.52 
 
 		 560 aa  689    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  65.64 
 
 		 553 aa  719    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  64.32 
 
 		 552 aa  711    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  66 
 
 		 556 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  68.13 
 
 		 545 aa  726    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  67.51 
 
 		 551 aa  721    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  68.06 
 
 		 551 aa  725    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  64.49 
 
 		 552 aa  706    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  64.68 
 
 		 552 aa  712    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  64.49 
 
 		 552 aa  706    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  66.18 
 
 		 556 aa  715    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  64.49 
 
 		 552 aa  706    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  63.51 
 
 		 572 aa  693    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  64.4 
 
 		 561 aa  686    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  65.49 
 
 		 569 aa  715    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  63.33 
 
 		 572 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  63.51 
 
 		 572 aa  693    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  65.19 
 
 		 564 aa  706    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  63.51 
 
 		 570 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  64.44 
 
 		 569 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  64.56 
 
 		 553 aa  711    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  64.49 
 
 		 552 aa  706    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  100 
 
 		 547 aa  1077    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  67.7 
 
 		 551 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  63.24 
 
 		 573 aa  711    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  69.31 
 
 		 560 aa  746    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  64.52 
 
 		 560 aa  689    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  67.33 
 
 		 551 aa  719    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  64.56 
 
 		 553 aa  709    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  67.33 
 
 		 551 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  66.37 
 
 		 566 aa  703    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  64.77 
 
 		 562 aa  701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  67.33 
 
 		 551 aa  742    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  67.33 
 
 		 551 aa  719    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  64.31 
 
 		 566 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  67.51 
 
 		 551 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  64.52 
 
 		 560 aa  689    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  64.31 
 
 		 566 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  64.16 
 
 		 560 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  67.51 
 
 		 551 aa  742    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  64.52 
 
 		 560 aa  689    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  70.11 
 
 		 552 aa  726    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  64.14 
 
 		 557 aa  714    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  67.33 
 
 		 551 aa  719    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  67.33 
 
 		 551 aa  719    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  67.51 
 
 		 551 aa  721    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  66.54 
 
 		 556 aa  720    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  67.33 
 
 		 551 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  64.67 
 
 		 552 aa  708    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  63.51 
 
 		 572 aa  693    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  64.7 
 
 		 560 aa  690    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  63.33 
 
 		 572 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  63.33 
 
 		 572 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  54.5 
 
 		 592 aa  591  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  57.04 
 
 		 557 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  56.57 
 
 		 552 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  56.33 
 
 		 558 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  53.3 
 
 		 576 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  55.56 
 
 		 554 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  52.61 
 
 		 565 aa  549  1e-155  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0490  L-lactate transport  52.91 
 
 		 541 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  54.31 
 
 		 575 aa  550  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  52.61 
 
 		 560 aa  549  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  53.76 
 
 		 589 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  52.36 
 
 		 560 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  53.1 
 
 		 551 aa  534  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  49.25 
 
 		 539 aa  521  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  49.63 
 
 		 539 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  49.63 
 
 		 539 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  50 
 
 		 539 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000690012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  51.44 
 
 		 551 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  50.28 
 
 		 545 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  50.73 
 
 		 543 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  49.44 
 
 		 539 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  49.25 
 
 		 539 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  49.06 
 
 		 539 aa  511  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  49.36 
 
 		 545 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  49.25 
 
 		 539 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  49.25 
 
 		 539 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  49.25 
 
 		 539 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  49.25 
 
 		 539 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  47.61 
 
 		 548 aa  496  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000751768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  45 
 
 		 556 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0149  glycolate permease GlcA  51.85 
 
 		 531 aa  479  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  46.14 
 
 		 557 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  46 
 
 		 557 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  46 
 
 		 557 aa  475  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  45.88 
 
 		 558 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  45.6 
 
 		 557 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  47.21 
 
 		 555 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  45.03 
 
 		 552 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  45.21 
 
 		 553 aa  462  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  45.39 
 
 		 553 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>