258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3238 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  76.58 
 
 		 569 aa  844    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  65.61 
 
 		 562 aa  716    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  100 
 
 		 570 aa  1127    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  62.98 
 
 		 568 aa  671    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  78.92 
 
 		 570 aa  863    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  78.42 
 
 		 570 aa  859    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  77.02 
 
 		 570 aa  874    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  47.33 
 
 		 553 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  46.38 
 
 		 601 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  45.52 
 
 		 564 aa  465  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  45.6 
 
 		 564 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  45.8 
 
 		 574 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  46.33 
 
 		 575 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  46.02 
 
 		 563 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  46.95 
 
 		 563 aa  455  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  47.78 
 
 		 566 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  45.24 
 
 		 582 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  44.4 
 
 		 568 aa  450  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  46.44 
 
 		 620 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  44.28 
 
 		 588 aa  425  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  44.56 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  44.55 
 
 		 564 aa  418  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  41.58 
 
 		 623 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  44.55 
 
 		 585 aa  414  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  42.46 
 
 		 567 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  42.24 
 
 		 611 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  43.06 
 
 		 585 aa  404  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  43.72 
 
 		 586 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  41.44 
 
 		 590 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  42.04 
 
 		 610 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  41.28 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  41.49 
 
 		 578 aa  386  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  43.24 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  41.44 
 
 		 547 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  41.44 
 
 		 547 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  41.44 
 
 		 547 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  41.44 
 
 		 547 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  40.29 
 
 		 547 aa  365  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  40.65 
 
 		 548 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  40.65 
 
 		 548 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  40.43 
 
 		 547 aa  363  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  39.82 
 
 		 547 aa  363  6e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  40.54 
 
 		 547 aa  362  8e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  40.46 
 
 		 547 aa  362  9e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  40.29 
 
 		 547 aa  361  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  39.1 
 
 		 547 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  37.41 
 
 		 563 aa  355  2e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  40.47 
 
 		 550 aa  350  4e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  39.15 
 
 		 557 aa  333  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  35.75 
 
 		 570 aa  326  8.000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.27 
 
 		 538 aa  297  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  34.53 
 
 		 534 aa  269  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  35.62 
 
 		 526 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  33.51 
 
 		 530 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  34.02 
 
 		 544 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  32.25 
 
 		 511 aa  246  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  33.07 
 
 		 559 aa  228  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  30.27 
 
 		 565 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  30.27 
 
 		 560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  31.56 
 
 		 551 aa  190  5.999999999999999e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  30.1 
 
 		 560 aa  186  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  27.73 
 
 		 545 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  27.84 
 
 		 551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  27.84 
 
 		 551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  27.84 
 
 		 551 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  28.74 
 
 		 586 aa  174  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  27.67 
 
 		 551 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  27.89 
 
 		 553 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  28.5 
 
 		 553 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  32.92 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  27.89 
 
 		 553 aa  170  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  27.87 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  27.94 
 
 		 553 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  28.62 
 
 		 557 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  28.01 
 
 		 556 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  28.03 
 
 		 556 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  27.46 
 
 		 552 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  28.45 
 
 		 570 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  28.03 
 
 		 556 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  28.15 
 
 		 556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  27.3 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  27.3 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  27.3 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  27.3 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  27.3 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  26.76 
 
 		 576 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  28.52 
 
 		 557 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  27.81 
 
 		 545 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  27.37 
 
 		 561 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  28.47 
 
 		 556 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  27.88 
 
 		 562 aa  160  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  27.67 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  27.59 
 
 		 506 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  27.66 
 
 		 551 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  29.53 
 
 		 558 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  28.11 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  27.62 
 
 		 560 aa  159  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  28.11 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  28.11 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  31 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>