263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0827 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  66.85 
 
 		 560 aa  721    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  67.28 
 
 		 551 aa  700    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  67.28 
 
 		 551 aa  699    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  66.49 
 
 		 560 aa  718    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  66.31 
 
 		 569 aa  697    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  69.54 
 
 		 556 aa  759    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  66.85 
 
 		 560 aa  721    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  66.3 
 
 		 552 aa  732    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  100 
 
 		 545 aa  1065    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  65.46 
 
 		 561 aa  696    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  67.28 
 
 		 551 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  65.76 
 
 		 552 aa  723    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  65.76 
 
 		 552 aa  723    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  67.99 
 
 		 561 aa  732    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  66.85 
 
 		 560 aa  721    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  65.76 
 
 		 552 aa  723    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  62.21 
 
 		 572 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  66.12 
 
 		 552 aa  728    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  67.2 
 
 		 569 aa  726    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  62.03 
 
 		 572 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  62.21 
 
 		 572 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  68.23 
 
 		 564 aa  727    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  64.66 
 
 		 570 aa  711    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  67.28 
 
 		 551 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  69.36 
 
 		 556 aa  758    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  66.85 
 
 		 560 aa  721    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  65.76 
 
 		 552 aa  723    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  68.13 
 
 		 547 aa  691    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  67.28 
 
 		 551 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  61.7 
 
 		 573 aa  688    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  67.28 
 
 		 551 aa  699    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  65.82 
 
 		 553 aa  727    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  67.09 
 
 		 551 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  65.58 
 
 		 552 aa  722    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  68.1 
 
 		 566 aa  712    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  67.15 
 
 		 552 aa  690    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  67.28 
 
 		 551 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  67.27 
 
 		 560 aa  715    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  64.73 
 
 		 553 aa  712    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  67.28 
 
 		 551 aa  700    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  66.55 
 
 		 553 aa  729    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  65.84 
 
 		 566 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  66.61 
 
 		 560 aa  732    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  69.72 
 
 		 556 aa  754    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  67.28 
 
 		 551 aa  700    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  69.54 
 
 		 556 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  67.28 
 
 		 551 aa  699    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  65.84 
 
 		 566 aa  706    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  67.28 
 
 		 551 aa  700    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  65.64 
 
 		 553 aa  722    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  67.28 
 
 		 551 aa  700    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  67.28 
 
 		 551 aa  700    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  67.34 
 
 		 557 aa  724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  66.85 
 
 		 560 aa  721    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  67.09 
 
 		 551 aa  705    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  67.03 
 
 		 560 aa  721    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  67.74 
 
 		 562 aa  745    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  62.21 
 
 		 572 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  62.21 
 
 		 572 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  62.03 
 
 		 572 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  57.54 
 
 		 552 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  54.34 
 
 		 592 aa  583  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  55.18 
 
 		 557 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  56.23 
 
 		 558 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  53.73 
 
 		 543 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  56.93 
 
 		 554 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  52.73 
 
 		 551 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  53.38 
 
 		 576 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  55.31 
 
 		 575 aa  558  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  53.79 
 
 		 589 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  52.48 
 
 		 545 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  51.59 
 
 		 539 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  50.37 
 
 		 545 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  50.84 
 
 		 539 aa  528  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  50.84 
 
 		 539 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  50.66 
 
 		 539 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  50.47 
 
 		 539 aa  524  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000690012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  50.66 
 
 		 539 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  51.28 
 
 		 565 aa  521  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  50.47 
 
 		 539 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  50.66 
 
 		 539 aa  521  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  50.47 
 
 		 539 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  50.66 
 
 		 539 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  50.81 
 
 		 560 aa  520  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  50.47 
 
 		 539 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  50.27 
 
 		 560 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  48.81 
 
 		 556 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  49.53 
 
 		 548 aa  511  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000751768  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  47.98 
 
 		 557 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  47.79 
 
 		 557 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0490  L-lactate transport  49.81 
 
 		 541 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  49.17 
 
 		 555 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  51.92 
 
 		 551 aa  497  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  48.37 
 
 		 558 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  48.18 
 
 		 557 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  47.99 
 
 		 557 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  44.65 
 
 		 552 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  45.19 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7063  L-lactate transport  45.21 
 
 		 559 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0419328  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  45.19 
 
 		 553 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>