263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43260 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  78.15 
 
 
560 aa  848    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  62.86 
 
 
551 aa  673    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  63.04 
 
 
551 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  77.8 
 
 
560 aa  845    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  63.04 
 
 
551 aa  674    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  70.47 
 
 
569 aa  727    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  78.79 
 
 
556 aa  861    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  78.15 
 
 
560 aa  848    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  66.07 
 
 
552 aa  727    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  66.19 
 
 
552 aa  726    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  63.75 
 
 
551 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  65.12 
 
 
545 aa  717    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  66.73 
 
 
552 aa  724    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  66.73 
 
 
552 aa  724    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  64.94 
 
 
553 aa  715    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  78.79 
 
 
556 aa  861    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  66.73 
 
 
552 aa  724    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  66.96 
 
 
572 aa  738    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  79.14 
 
 
557 aa  869    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  71.25 
 
 
569 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  66.78 
 
 
572 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  66.96 
 
 
572 aa  738    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  80.18 
 
 
564 aa  855    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  70.65 
 
 
570 aa  774    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  100 
 
 
561 aa  1089    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  65.89 
 
 
560 aa  695    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  66.73 
 
 
552 aa  724    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  64.4 
 
 
547 aa  669    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  63.75 
 
 
551 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  67.36 
 
 
573 aa  759    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  78.15 
 
 
560 aa  848    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  62.86 
 
 
551 aa  673    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  66.07 
 
 
553 aa  731    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  62.86 
 
 
551 aa  673    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  78.79 
 
 
556 aa  861    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  70.74 
 
 
566 aa  732    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  64.76 
 
 
552 aa  697    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  63.39 
 
 
551 aa  687    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  71.25 
 
 
566 aa  753    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  65.96 
 
 
553 aa  728    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  78.15 
 
 
560 aa  848    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  62.86 
 
 
551 aa  673    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  71.6 
 
 
566 aa  754    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  63.93 
 
 
551 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  80.04 
 
 
560 aa  871    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  78.79 
 
 
556 aa  856    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  63.93 
 
 
551 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  78.15 
 
 
560 aa  848    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  78.15 
 
 
560 aa  848    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  63.93 
 
 
551 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  65.36 
 
 
553 aa  726    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  63.04 
 
 
551 aa  674    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  62.86 
 
 
551 aa  673    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  85.03 
 
 
561 aa  912    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  62.86 
 
 
551 aa  673    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  66.55 
 
 
552 aa  723    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  66.96 
 
 
572 aa  738    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  80.43 
 
 
562 aa  903    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  66.96 
 
 
572 aa  739    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  66.78 
 
 
572 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  57.45 
 
 
552 aa  596  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  57.32 
 
 
554 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  54.86 
 
 
592 aa  572  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  55.2 
 
 
575 aa  557  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  52.7 
 
 
576 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  54.8 
 
 
557 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  54.34 
 
 
558 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  51.79 
 
 
589 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  50.09 
 
 
539 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  50.09 
 
 
539 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000690012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  49.37 
 
 
539 aa  531  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  50.09 
 
 
539 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  50.09 
 
 
539 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  49.19 
 
 
539 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  49.19 
 
 
539 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  50.63 
 
 
545 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  49.19 
 
 
539 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  49.19 
 
 
539 aa  524  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  49.19 
 
 
539 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  51.15 
 
 
543 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  49.01 
 
 
539 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  50.09 
 
 
551 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  48.76 
 
 
560 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  48.58 
 
 
565 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  48.48 
 
 
545 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  48.58 
 
 
560 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  50.63 
 
 
551 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0490  L-lactate transport  48.35 
 
 
541 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  46.54 
 
 
556 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  46.74 
 
 
557 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7063  L-lactate transport  45.6 
 
 
559 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0419328  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  46.74 
 
 
557 aa  464  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  47.62 
 
 
557 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0561  L-lactate transport  43.57 
 
 
560 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.044221  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  47.27 
 
 
557 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  45.73 
 
 
558 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6242  L-lactate transport  44.54 
 
 
559 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0908  L-lactate transport  45.73 
 
 
558 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00938786  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2515  L-lactate transport  45.91 
 
 
558 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.419445  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  45.5 
 
 
552 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>