262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5295 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4223  L-lactate transport  58.83 
 
 		 579 aa  638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1327  L-lactate transport  61.23 
 
 		 554 aa  654    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0981  putative L-lactate permease transmembrane protein  65.35 
 
 		 562 aa  699    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175298  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  66.61 
 
 		 557 aa  728    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  100 
 
 		 552 aa  1096    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4593  L-lactate transport  59.01 
 
 		 579 aa  639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4740  L-lactate transport  59.72 
 
 		 579 aa  657    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1762  L-lactate permease  67.94 
 
 		 578 aa  759    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.68133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2353  L-lactate permease  64.07 
 
 		 558 aa  688    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4730  L-lactate transport  62.68 
 
 		 554 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.833176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4131  L-lactate transport  61.41 
 
 		 554 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.868822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0908  L-lactate transport  65.47 
 
 		 558 aa  706    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00938786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2515  L-lactate transport  66.55 
 
 		 558 aa  707    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.419445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  67.09 
 
 		 558 aa  716    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6242  L-lactate transport  59.54 
 
 		 559 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  66.61 
 
 		 557 aa  728    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2428  L-lactate transport  62.37 
 
 		 584 aa  673    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  66.97 
 
 		 555 aa  712    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0561  L-lactate transport  62.37 
 
 		 560 aa  702    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.044221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7063  L-lactate transport  59.82 
 
 		 559 aa  643    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0419328  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  84.39 
 
 		 553 aa  942    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1668  LctP family glycolate permease  59.6 
 
 		 554 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.646822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5796  L-lactate transport  81.31 
 
 		 553 aa  884    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  65.05 
 
 		 561 aa  695    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  83.48 
 
 		 553 aa  927    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  82.91 
 
 		 552 aa  927    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  84.75 
 
 		 553 aa  946    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2209  putative L-lactate permease transmembrane protein  80.76 
 
 		 553 aa  855    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.771798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0640  L-lactate transport  59.12 
 
 		 578 aa  631  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.391277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  58.36 
 
 		 586 aa  630  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  59.05 
 
 		 556 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  59.42 
 
 		 557 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  59.17 
 
 		 557 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  58.56 
 
 		 558 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  48.16 
 
 		 543 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  45.89 
 
 		 551 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  44.65 
 
 		 545 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  46.73 
 
 		 545 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  46.21 
 
 		 592 aa  474  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  46.62 
 
 		 545 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  45.47 
 
 		 556 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  45.29 
 
 		 556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  46.19 
 
 		 569 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  45.29 
 
 		 556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  45.57 
 
 		 556 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  47.44 
 
 		 575 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  45.97 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  43.84 
 
 		 551 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  43.84 
 
 		 551 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  43.84 
 
 		 551 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  43.84 
 
 		 551 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  44.27 
 
 		 562 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  45.05 
 
 		 560 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  43.25 
 
 		 576 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  44.57 
 
 		 557 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  44.82 
 
 		 560 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  44.82 
 
 		 560 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  44.82 
 
 		 560 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  45.37 
 
 		 557 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  44.64 
 
 		 560 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  44.82 
 
 		 560 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  44.82 
 
 		 560 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  44.46 
 
 		 560 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  45.9 
 
 		 547 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  46.31 
 
 		 566 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  45.45 
 
 		 552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  42.31 
 
 		 553 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  44.17 
 
 		 564 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  44.96 
 
 		 569 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  41.77 
 
 		 553 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  43.84 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  42.31 
 
 		 552 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  42 
 
 		 552 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  42 
 
 		 552 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  42 
 
 		 552 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  42 
 
 		 552 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  42 
 
 		 552 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  43.08 
 
 		 573 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  43.48 
 
 		 551 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  41.95 
 
 		 553 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  43.66 
 
 		 551 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  43.66 
 
 		 551 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  43.66 
 
 		 551 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  43.66 
 
 		 551 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  44.95 
 
 		 560 aa  438  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  43.66 
 
 		 551 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  45.89 
 
 		 558 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  42.27 
 
 		 570 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  43.66 
 
 		 551 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  44.19 
 
 		 561 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  43.66 
 
 		 551 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  43.66 
 
 		 551 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  41.45 
 
 		 552 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  43.66 
 
 		 551 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  41.64 
 
 		 553 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  43.92 
 
 		 572 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  43.92 
 
 		 572 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  43.92 
 
 		 572 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  43.92 
 
 		 572 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  43.92 
 
 		 572 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>