262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4730 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  61.52 
 
 
555 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1327  L-lactate transport  88.99 
 
 
554 aa  961    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0981  putative L-lactate permease transmembrane protein  63.28 
 
 
562 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175298  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4593  L-lactate transport  68.37 
 
 
579 aa  743    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.143027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1668  LctP family glycolate permease  86.46 
 
 
554 aa  949    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.646822  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  60.62 
 
 
557 aa  660    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4223  L-lactate transport  68.37 
 
 
579 aa  742    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7063  L-lactate transport  68.93 
 
 
559 aa  756    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0419328  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5796  L-lactate transport  60.29 
 
 
553 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.325715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0908  L-lactate transport  63.64 
 
 
558 aa  686    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00938786  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0561  L-lactate transport  62.86 
 
 
560 aa  701    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.044221  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1762  L-lactate permease  60.21 
 
 
578 aa  669    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.68133  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2353  L-lactate permease  64.58 
 
 
558 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  62.64 
 
 
553 aa  681    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4730  L-lactate transport  100 
 
 
554 aa  1087    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.833176 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  63.99 
 
 
558 aa  693    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4131  L-lactate transport  91.88 
 
 
554 aa  1012    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.868822  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2515  L-lactate transport  62.9 
 
 
558 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.419445  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  60.76 
 
 
586 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6242  L-lactate transport  71.07 
 
 
559 aa  774    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4740  L-lactate transport  67.49 
 
 
579 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0179347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  60.97 
 
 
561 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0640  L-lactate transport  68.25 
 
 
578 aa  723    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.391277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2428  L-lactate transport  64.21 
 
 
584 aa  703    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  60.62 
 
 
557 aa  663    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  62.68 
 
 
552 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  63.65 
 
 
553 aa  679    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  62.09 
 
 
552 aa  676    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  62.64 
 
 
553 aa  683    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2209  putative L-lactate permease transmembrane protein  63.06 
 
 
553 aa  652    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.771798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  57.14 
 
 
556 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  56.47 
 
 
557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  55.83 
 
 
557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  55.98 
 
 
558 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  46.26 
 
 
560 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  46.26 
 
 
560 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  46.26 
 
 
560 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  46.26 
 
 
560 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  46.26 
 
 
560 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  46.26 
 
 
560 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  45.91 
 
 
560 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  44.34 
 
 
545 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  44.39 
 
 
562 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  43.35 
 
 
552 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  44.71 
 
 
556 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  44.71 
 
 
556 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  44.71 
 
 
556 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  42.88 
 
 
553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  42.88 
 
 
553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  43.07 
 
 
552 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  45.97 
 
 
575 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  44.71 
 
 
556 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  42.88 
 
 
552 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  42.34 
 
 
552 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  43.16 
 
 
561 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  42.34 
 
 
552 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  42.34 
 
 
552 aa  443  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  42.34 
 
 
552 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  42.34 
 
 
552 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  44.44 
 
 
557 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  42.44 
 
 
553 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  44.06 
 
 
545 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  41.62 
 
 
551 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  41.62 
 
 
551 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  41.62 
 
 
551 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  44.01 
 
 
560 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  41.62 
 
 
551 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  42.34 
 
 
553 aa  438  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  43.01 
 
 
554 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  42.75 
 
 
592 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  43.72 
 
 
570 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  43.22 
 
 
543 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  43.94 
 
 
560 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  43.23 
 
 
569 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  43.51 
 
 
564 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  42.5 
 
 
561 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  42.52 
 
 
545 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  44.1 
 
 
547 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  41.43 
 
 
551 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  40.62 
 
 
576 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  40.74 
 
 
573 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  43.29 
 
 
566 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  43.11 
 
 
566 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  41.83 
 
 
551 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  42.16 
 
 
551 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  42.16 
 
 
551 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  42.16 
 
 
551 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  42.16 
 
 
551 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  42.16 
 
 
551 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  42.16 
 
 
551 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  42.16 
 
 
551 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  42 
 
 
551 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  42.16 
 
 
551 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  42.16 
 
 
551 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  43.08 
 
 
569 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  41.28 
 
 
572 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  44.46 
 
 
566 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  41.28 
 
 
572 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  41.28 
 
 
572 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  41.28 
 
 
572 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>