262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0981 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  92.29 
 
 		 558 aa  1025    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0908  L-lactate transport  91.94 
 
 		 558 aa  1003    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00938786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0981  putative L-lactate permease transmembrane protein  100 
 
 		 562 aa  1105    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175298  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  65.89 
 
 		 561 aa  699    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  64.21 
 
 		 557 aa  717    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1668  LctP family glycolate permease  62.39 
 
 		 554 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.646822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1762  L-lactate permease  65.46 
 
 		 578 aa  708    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.68133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2353  L-lactate permease  83.72 
 
 		 558 aa  890    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2428  L-lactate transport  66.38 
 
 		 584 aa  709    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0640  L-lactate transport  61.01 
 
 		 578 aa  645    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.391277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4223  L-lactate transport  61.62 
 
 		 579 aa  652    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4730  L-lactate transport  63.46 
 
 		 554 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.833176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4131  L-lactate transport  63.64 
 
 		 554 aa  689    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.868822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  64.39 
 
 		 557 aa  718    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4740  L-lactate transport  61.84 
 
 		 579 aa  668    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2515  L-lactate transport  82.8 
 
 		 558 aa  884    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.419445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  60.14 
 
 		 586 aa  651    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6242  L-lactate transport  64.7 
 
 		 559 aa  691    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  66.37 
 
 		 555 aa  715    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0561  L-lactate transport  63.51 
 
 		 560 aa  690    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.044221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  65.35 
 
 		 552 aa  706    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  67.56 
 
 		 553 aa  731    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1327  L-lactate transport  65.78 
 
 		 554 aa  704    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5796  L-lactate transport  65.05 
 
 		 553 aa  690    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4593  L-lactate transport  61.44 
 
 		 579 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143027 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  67.86 
 
 		 553 aa  720    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  63.8 
 
 		 552 aa  706    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  67.74 
 
 		 553 aa  734    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7063  L-lactate transport  64.52 
 
 		 559 aa  689    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0419328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2209  putative L-lactate permease transmembrane protein  68.82 
 
 		 553 aa  719    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.771798 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  56.36 
 
 		 557 aa  591  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  57.17 
 
 		 556 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  56.31 
 
 		 557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  56.61 
 
 		 558 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  48.18 
 
 		 545 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  43.76 
 
 		 545 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  47.29 
 
 		 552 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  45.83 
 
 		 575 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  46.8 
 
 		 560 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  46.09 
 
 		 557 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  45.34 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  45.55 
 
 		 560 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  45.34 
 
 		 556 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  45.55 
 
 		 560 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  45.55 
 
 		 560 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  46.18 
 
 		 564 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  45.93 
 
 		 556 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  44.6 
 
 		 552 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  45.55 
 
 		 560 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  45.34 
 
 		 556 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  45.55 
 
 		 560 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  45.55 
 
 		 560 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  43.17 
 
 		 543 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  44.67 
 
 		 545 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  45.2 
 
 		 560 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  45.73 
 
 		 562 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  44.06 
 
 		 553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  43.5 
 
 		 552 aa  445  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  42.83 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  43.35 
 
 		 553 aa  442  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  46.47 
 
 		 561 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  43.86 
 
 		 552 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  43.86 
 
 		 552 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  43.86 
 
 		 552 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  43.86 
 
 		 552 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  43.86 
 
 		 552 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  42.55 
 
 		 553 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  45.67 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  44.99 
 
 		 592 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  43.92 
 
 		 573 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  42.43 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  45.73 
 
 		 561 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  43.06 
 
 		 551 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  43.06 
 
 		 551 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  42.7 
 
 		 551 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  42.88 
 
 		 551 aa  432  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  43.4 
 
 		 553 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  43.24 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  43.24 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  44.22 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  43.24 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  43.24 
 
 		 572 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  43.24 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  43.24 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  42.42 
 
 		 569 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  43.14 
 
 		 547 aa  422  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  41.39 
 
 		 570 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  42.5 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  42.88 
 
 		 551 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  42.32 
 
 		 566 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  42.52 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  42.52 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  42.52 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  42.52 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  42.52 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  42.52 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  42.52 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  42.21 
 
 		 558 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  42.52 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  42.52 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>