263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2129 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  73.32 
 
 
545 aa  802    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  100 
 
 
551 aa  1101    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  81.31 
 
 
543 aa  915    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  70.24 
 
 
545 aa  793    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  52.73 
 
 
545 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  54.07 
 
 
592 aa  561  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  53.9 
 
 
589 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  51.72 
 
 
552 aa  549  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  53.31 
 
 
575 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  52.94 
 
 
556 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  52.94 
 
 
556 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  52.94 
 
 
556 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  52.5 
 
 
556 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  51.75 
 
 
562 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  50.35 
 
 
557 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  51.63 
 
 
554 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  49.56 
 
 
556 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  52.57 
 
 
564 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  50.98 
 
 
557 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  50.27 
 
 
560 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  50.27 
 
 
560 aa  520  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  50.45 
 
 
560 aa  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  50.27 
 
 
560 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  50.63 
 
 
560 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  50.27 
 
 
560 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  50.27 
 
 
560 aa  520  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  49.91 
 
 
560 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  50.35 
 
 
561 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  48.83 
 
 
553 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  49.2 
 
 
551 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  49.38 
 
 
551 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  49.01 
 
 
553 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  50.35 
 
 
558 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  49.38 
 
 
551 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  51.76 
 
 
566 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  48.65 
 
 
576 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  49.01 
 
 
553 aa  514  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  49.2 
 
 
551 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  48.66 
 
 
553 aa  509  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  48.01 
 
 
552 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  48.38 
 
 
552 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  48.38 
 
 
552 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  48.38 
 
 
552 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  48.38 
 
 
552 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  49.65 
 
 
569 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  50.09 
 
 
561 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  48.38 
 
 
552 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  49.64 
 
 
560 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  48.38 
 
 
552 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  49.46 
 
 
551 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  50.9 
 
 
547 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  47.73 
 
 
573 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  48.26 
 
 
570 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  49.38 
 
 
551 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  48.49 
 
 
551 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  48.49 
 
 
551 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  48.49 
 
 
551 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  48.49 
 
 
551 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  46.72 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  48.49 
 
 
551 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  48.49 
 
 
551 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  48.49 
 
 
551 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  48.49 
 
 
551 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  48.49 
 
 
551 aa  492  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  47.96 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  49.23 
 
 
569 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  48.34 
 
 
572 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  48.34 
 
 
572 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  48.34 
 
 
572 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  48.25 
 
 
566 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  47.61 
 
 
557 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  47.07 
 
 
561 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  48.43 
 
 
566 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  46.72 
 
 
557 aa  490  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  46.01 
 
 
553 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  48.34 
 
 
572 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  48.34 
 
 
572 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  48.34 
 
 
572 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  48.05 
 
 
558 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  46.01 
 
 
553 aa  488  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  46.71 
 
 
555 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  49.38 
 
 
552 aa  482  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  45.24 
 
 
586 aa  484  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  45.47 
 
 
553 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  45.82 
 
 
552 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  45.89 
 
 
552 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1762  L-lactate permease  45.52 
 
 
578 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.68133  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5796  L-lactate transport  45.29 
 
 
553 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.325715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0908  L-lactate transport  44.24 
 
 
558 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00938786  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  44.42 
 
 
558 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0561  L-lactate transport  44.27 
 
 
560 aa  455  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.044221  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2515  L-lactate transport  44.21 
 
 
558 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.419445  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2353  L-lactate permease  43.71 
 
 
558 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2428  L-lactate transport  42.27 
 
 
584 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4740  L-lactate transport  43.29 
 
 
579 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0179347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6242  L-lactate transport  43.63 
 
 
559 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2209  putative L-lactate permease transmembrane protein  45.5 
 
 
553 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.771798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7063  L-lactate transport  43.27 
 
 
559 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0419328  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0981  putative L-lactate permease transmembrane protein  42.55 
 
 
562 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175298  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4223  L-lactate transport  42.93 
 
 
579 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>