262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_2185 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  68.3 
 
 
560 aa  748    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  59.47 
 
 
551 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  59.47 
 
 
551 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  67.95 
 
 
560 aa  745    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  68.95 
 
 
566 aa  762    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  69.11 
 
 
556 aa  787    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  68.3 
 
 
560 aa  748    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  68.36 
 
 
561 aa  748    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  68.3 
 
 
560 aa  748    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  62.46 
 
 
553 aa  704    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  62.28 
 
 
552 aa  700    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  62.21 
 
 
545 aa  688    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  61.93 
 
 
552 aa  694    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  61.75 
 
 
553 aa  701    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  61.93 
 
 
552 aa  694    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  60 
 
 
551 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  68.3 
 
 
560 aa  748    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  61.93 
 
 
552 aa  694    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  100 
 
 
572 aa  1117    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  71.03 
 
 
569 aa  777    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  99.83 
 
 
572 aa  1115    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  100 
 
 
572 aa  1117    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  68.88 
 
 
564 aa  758    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  68.6 
 
 
570 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  69.11 
 
 
556 aa  787    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  61.93 
 
 
552 aa  694    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  63.53 
 
 
547 aa  678    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  59.47 
 
 
551 aa  639    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  94.76 
 
 
573 aa  1039    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  67.83 
 
 
557 aa  762    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  60.88 
 
 
552 aa  661    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  61.75 
 
 
552 aa  693    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  59.47 
 
 
551 aa  639    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  60.53 
 
 
553 aa  693    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  71.23 
 
 
566 aa  748    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  68.88 
 
 
561 aa  762    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  61.58 
 
 
552 aa  698    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  59.47 
 
 
551 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  70.23 
 
 
569 aa  742    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  62.5 
 
 
560 aa  658    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  68.3 
 
 
560 aa  748    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  68.94 
 
 
556 aa  788    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  68.95 
 
 
566 aa  761    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  60.18 
 
 
551 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  69.23 
 
 
560 aa  768    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  60 
 
 
551 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  69.28 
 
 
556 aa  789    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  59.47 
 
 
551 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  59.47 
 
 
551 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  60.18 
 
 
551 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  59.47 
 
 
551 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  62.28 
 
 
553 aa  699    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  59.47 
 
 
551 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  60.35 
 
 
551 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  68.18 
 
 
562 aa  766    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  60 
 
 
551 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  100 
 
 
572 aa  1117    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  68.48 
 
 
560 aa  748    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  99.3 
 
 
572 aa  1110    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  99.83 
 
 
572 aa  1115    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  52.01 
 
 
552 aa  545  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  49.47 
 
 
576 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  52.99 
 
 
554 aa  535  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  52.16 
 
 
557 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  51.32 
 
 
575 aa  529  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  49.38 
 
 
545 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  50.62 
 
 
592 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  49.48 
 
 
560 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  49.04 
 
 
565 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  49.04 
 
 
560 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  47.67 
 
 
539 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  47.13 
 
 
539 aa  505  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  47.67 
 
 
539 aa  502  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  47.31 
 
 
539 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  46.95 
 
 
539 aa  498  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  46.95 
 
 
539 aa  498  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  49.48 
 
 
551 aa  499  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  46.95 
 
 
539 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  48.34 
 
 
551 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0490  L-lactate transport  49.29 
 
 
541 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  47.49 
 
 
539 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000690012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  47.49 
 
 
539 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  47.49 
 
 
539 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  49.74 
 
 
558 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  47.55 
 
 
589 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  46.77 
 
 
539 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  47.98 
 
 
543 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  47.72 
 
 
556 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0149  glycolate permease GlcA  49.82 
 
 
531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  46.55 
 
 
545 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  45.2 
 
 
557 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  45.2 
 
 
557 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  47.06 
 
 
555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  44.87 
 
 
553 aa  451  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  44.5 
 
 
558 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  44.17 
 
 
552 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  44.7 
 
 
553 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  46.18 
 
 
561 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  42.6 
 
 
548 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000751768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  43.86 
 
 
553 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>