263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2301 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  79.64 
 
 		 560 aa  860    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  64.06 
 
 		 551 aa  690    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  64.23 
 
 		 551 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  79.29 
 
 		 560 aa  858    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  66.91 
 
 		 552 aa  723    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  65.89 
 
 		 560 aa  706    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  71.78 
 
 		 569 aa  753    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  82.35 
 
 		 556 aa  902    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  79.64 
 
 		 560 aa  860    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  84.16 
 
 		 562 aa  932    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  82.35 
 
 		 556 aa  902    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  67.55 
 
 		 552 aa  755    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  67.99 
 
 		 545 aa  754    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  79.64 
 
 		 560 aa  860    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  68.16 
 
 		 552 aa  753    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  68.16 
 
 		 552 aa  753    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  67.73 
 
 		 553 aa  759    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  68.16 
 
 		 552 aa  753    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  68.01 
 
 		 572 aa  749    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  73.54 
 
 		 569 aa  788    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  67.83 
 
 		 572 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  68.01 
 
 		 572 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  80.85 
 
 		 564 aa  872    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  71.88 
 
 		 570 aa  784    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  85.03 
 
 		 561 aa  912    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  100 
 
 		 561 aa  1096    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  68.16 
 
 		 552 aa  753    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  66.19 
 
 		 547 aa  694    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  68.41 
 
 		 573 aa  772    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  65.47 
 
 		 551 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  82.17 
 
 		 557 aa  899    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  65.47 
 
 		 551 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  79.64 
 
 		 560 aa  860    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  79.64 
 
 		 560 aa  860    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  72.52 
 
 		 566 aa  755    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  68.34 
 
 		 552 aa  754    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  67.91 
 
 		 553 aa  765    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  65.3 
 
 		 551 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  64.23 
 
 		 551 aa  691    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  67.26 
 
 		 553 aa  742    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  72.57 
 
 		 566 aa  772    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  65.47 
 
 		 551 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  82.89 
 
 		 560 aa  902    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  82.35 
 
 		 556 aa  899    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  65.3 
 
 		 551 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  64.06 
 
 		 551 aa  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  82.35 
 
 		 556 aa  903    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  79.64 
 
 		 560 aa  860    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  64.06 
 
 		 551 aa  690    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  72.04 
 
 		 566 aa  768    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  65.3 
 
 		 551 aa  706    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  64.06 
 
 		 551 aa  690    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  64.23 
 
 		 551 aa  691    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  64.06 
 
 		 551 aa  690    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  66.84 
 
 		 553 aa  756    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  64.06 
 
 		 551 aa  690    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  67.38 
 
 		 552 aa  754    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  68.01 
 
 		 572 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  67.83 
 
 		 572 aa  749    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  67.83 
 
 		 572 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  56.43 
 
 		 552 aa  587  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  55.58 
 
 		 592 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  57.04 
 
 		 554 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  54.72 
 
 		 557 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  51.72 
 
 		 539 aa  559  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  52.84 
 
 		 576 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  54.62 
 
 		 558 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  52.08 
 
 		 539 aa  558  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000690012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  54.56 
 
 		 575 aa  558  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  51.72 
 
 		 539 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  51.72 
 
 		 539 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  51.18 
 
 		 539 aa  549  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  51.18 
 
 		 539 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  51.18 
 
 		 539 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  51.18 
 
 		 539 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  51.18 
 
 		 539 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  51.18 
 
 		 539 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  51.18 
 
 		 539 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  51.25 
 
 		 589 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  50.35 
 
 		 551 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  50.8 
 
 		 545 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  50.44 
 
 		 565 aa  527  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  50.09 
 
 		 560 aa  525  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  51.25 
 
 		 543 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  50.44 
 
 		 560 aa  526  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0490  L-lactate transport  50.18 
 
 		 541 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  52.24 
 
 		 551 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  47.59 
 
 		 545 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  48.24 
 
 		 556 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  46.67 
 
 		 557 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  46.67 
 
 		 557 aa  478  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0561  L-lactate transport  45.96 
 
 		 560 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.044221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  48.23 
 
 		 557 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  47.17 
 
 		 558 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  46.55 
 
 		 548 aa  474  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000751768  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  46.21 
 
 		 552 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7063  L-lactate transport  45.42 
 
 		 559 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0419328  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  47.54 
 
 		 553 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  46.38 
 
 		 553 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  47.76 
 
 		 561 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>