263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2673 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  69.2 
 
 		 560 aa  751    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  65.02 
 
 		 551 aa  693    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  65.19 
 
 		 551 aa  694    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  68.85 
 
 		 560 aa  748    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  82.07 
 
 		 569 aa  855    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  68.65 
 
 		 572 aa  759    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  73.63 
 
 		 556 aa  802    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  69.2 
 
 		 560 aa  751    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  65.49 
 
 		 553 aa  730    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  65.02 
 
 		 551 aa  693    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  66.02 
 
 		 552 aa  733    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  64.67 
 
 		 551 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  66.37 
 
 		 545 aa  727    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  65.02 
 
 		 551 aa  693    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  66.31 
 
 		 552 aa  732    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  66.31 
 
 		 552 aa  732    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  65.19 
 
 		 551 aa  694    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  66.31 
 
 		 552 aa  732    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  68.65 
 
 		 572 aa  759    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  69.2 
 
 		 557 aa  768    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  66.08 
 
 		 553 aa  735    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  83.51 
 
 		 569 aa  900    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  68.48 
 
 		 572 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  72.39 
 
 		 564 aa  778    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  94.39 
 
 		 570 aa  1023    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  100 
 
 		 566 aa  1097    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  66.31 
 
 		 552 aa  732    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  64.31 
 
 		 547 aa  684    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  64.66 
 
 		 551 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  70.05 
 
 		 573 aa  775    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  69.2 
 
 		 560 aa  751    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  65.26 
 
 		 560 aa  692    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  65.72 
 
 		 552 aa  702    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  73.63 
 
 		 556 aa  802    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  71.86 
 
 		 561 aa  766    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  73.1 
 
 		 556 aa  799    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  82.16 
 
 		 566 aa  847    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  66.14 
 
 		 552 aa  731    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  72.74 
 
 		 562 aa  793    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  65.72 
 
 		 553 aa  721    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  65.02 
 
 		 551 aa  693    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  64.67 
 
 		 551 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  65.02 
 
 		 551 aa  693    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  69.2 
 
 		 560 aa  751    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  64.27 
 
 		 551 aa  686    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  99.47 
 
 		 566 aa  1094    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  69.73 
 
 		 560 aa  769    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  72.93 
 
 		 556 aa  803    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  64.5 
 
 		 551 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  73.45 
 
 		 561 aa  781    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  64.67 
 
 		 551 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  66.37 
 
 		 552 aa  734    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  65.02 
 
 		 551 aa  693    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  65.49 
 
 		 553 aa  726    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  65.19 
 
 		 551 aa  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  69.2 
 
 		 560 aa  751    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  68.65 
 
 		 572 aa  759    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  69.38 
 
 		 560 aa  751    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  68.83 
 
 		 572 aa  763    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  68.48 
 
 		 572 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  52.84 
 
 		 552 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  51.6 
 
 		 576 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  51.51 
 
 		 592 aa  550  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  54.16 
 
 		 554 aa  549  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  52.85 
 
 		 557 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  52.49 
 
 		 575 aa  536  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  52.6 
 
 		 558 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  49.39 
 
 		 565 aa  519  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  49.39 
 
 		 560 aa  519  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  49.04 
 
 		 560 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  49.19 
 
 		 539 aa  512  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  49.1 
 
 		 539 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  48.92 
 
 		 539 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  48.92 
 
 		 539 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  48.92 
 
 		 539 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  48.92 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  48.92 
 
 		 539 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  48.56 
 
 		 539 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000690012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  48.92 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  50.09 
 
 		 551 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  48.92 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  49.47 
 
 		 589 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0490  L-lactate transport  49.01 
 
 		 541 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  48.75 
 
 		 539 aa  505  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  47.87 
 
 		 545 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  48.6 
 
 		 551 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  48.4 
 
 		 543 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  47.88 
 
 		 556 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  44.94 
 
 		 548 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000751768  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0149  glycolate permease GlcA  50 
 
 		 531 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  45.31 
 
 		 545 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  48.23 
 
 		 557 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  48.05 
 
 		 557 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  47.26 
 
 		 555 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  44.46 
 
 		 552 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  48.76 
 
 		 558 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4740  L-lactate transport  43.46 
 
 		 579 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  44.91 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  43.83 
 
 		 557 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  44.72 
 
 		 553 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>