259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1861 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  68.75 
 
 		 562 aa  741    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  77.02 
 
 		 570 aa  847    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  100 
 
 		 569 aa  1126    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  87.57 
 
 		 570 aa  943    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  84.56 
 
 		 570 aa  919    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  89.3 
 
 		 570 aa  990    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  57.82 
 
 		 568 aa  620  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  46.62 
 
 		 553 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  44.13 
 
 		 601 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  45.15 
 
 		 564 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  44.7 
 
 		 575 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  44.29 
 
 		 564 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  44.35 
 
 		 574 aa  445  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  43.89 
 
 		 582 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  44.19 
 
 		 563 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  43.56 
 
 		 568 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  45.31 
 
 		 563 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  46.61 
 
 		 566 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  45.34 
 
 		 620 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  42.35 
 
 		 588 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  43.83 
 
 		 566 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  42.3 
 
 		 611 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  40.64 
 
 		 567 aa  402  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  42.59 
 
 		 564 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  40.11 
 
 		 585 aa  396  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  39.86 
 
 		 623 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  40.46 
 
 		 585 aa  389  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  42.55 
 
 		 586 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  40.11 
 
 		 585 aa  387  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  41.29 
 
 		 610 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  39.02 
 
 		 590 aa  381  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  42.81 
 
 		 592 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  40.81 
 
 		 578 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  40.14 
 
 		 547 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  40.14 
 
 		 547 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  34.8 
 
 		 563 aa  351  2e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  40.14 
 
 		 547 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  40.14 
 
 		 547 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  39.5 
 
 		 547 aa  350  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  40.5 
 
 		 547 aa  350  4e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  39.61 
 
 		 547 aa  350  6e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  39.18 
 
 		 547 aa  345  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  39.79 
 
 		 548 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  39.79 
 
 		 548 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  39.25 
 
 		 547 aa  342  9e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  38.72 
 
 		 547 aa  340  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  38.9 
 
 		 547 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  39.25 
 
 		 550 aa  326  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  35.52 
 
 		 570 aa  324  2e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  38.97 
 
 		 557 aa  323  8e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.32 
 
 		 538 aa  273  8.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  33.16 
 
 		 534 aa  245  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  34.12 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  31.76 
 
 		 511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  34.08 
 
 		 544 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  31.66 
 
 		 530 aa  233  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  31.4 
 
 		 559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  29.32 
 
 		 565 aa  170  8e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  29.32 
 
 		 560 aa  170  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  28.79 
 
 		 551 aa  169  9e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  30.61 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  28.16 
 
 		 560 aa  169  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  27.26 
 
 		 576 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  25.7 
 
 		 545 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  25.69 
 
 		 551 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  25.69 
 
 		 551 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  25.69 
 
 		 551 aa  157  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  25.34 
 
 		 539 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  25.52 
 
 		 551 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  27.84 
 
 		 570 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  26.24 
 
 		 556 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  25.34 
 
 		 539 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  26.34 
 
 		 556 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  26.34 
 
 		 556 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  27.6 
 
 		 562 aa  154  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  26.45 
 
 		 561 aa  154  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  25.97 
 
 		 564 aa  153  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  26.24 
 
 		 556 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  26.6 
 
 		 553 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  25 
 
 		 539 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  26.79 
 
 		 557 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  26.92 
 
 		 586 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  30.99 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  25.76 
 
 		 560 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  25.76 
 
 		 560 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  25.76 
 
 		 560 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  25.76 
 
 		 560 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  25.76 
 
 		 560 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  27.17 
 
 		 506 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  25.59 
 
 		 560 aa  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  26.82 
 
 		 556 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  25.93 
 
 		 560 aa  151  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  26.41 
 
 		 561 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  26.57 
 
 		 558 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  32.78 
 
 		 494 aa  151  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  28.21 
 
 		 557 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  24.83 
 
 		 539 aa  150  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  24.83 
 
 		 539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  27.18 
 
 		 557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  24.66 
 
 		 539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>