264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3327 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  830    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  51.37 
 
 		 494 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  46.5 
 
 		 504 aa  289  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  48.72 
 
 		 548 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  33.64 
 
 		 506 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  31.29 
 
 		 564 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  33.47 
 
 		 564 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  33.1 
 
 		 506 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  29.61 
 
 		 563 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  32.21 
 
 		 553 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  31.83 
 
 		 564 aa  194  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  32.79 
 
 		 567 aa  192  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  30.26 
 
 		 582 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  36.16 
 
 		 592 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  31.87 
 
 		 506 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  31.06 
 
 		 620 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  35.52 
 
 		 610 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  31.71 
 
 		 566 aa  186  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  32.92 
 
 		 588 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  30.94 
 
 		 585 aa  184  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  31.25 
 
 		 574 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  32.04 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  31.06 
 
 		 575 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  33.87 
 
 		 566 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  30.33 
 
 		 585 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  33.05 
 
 		 547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  32.06 
 
 		 507 aa  180  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  34.27 
 
 		 586 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  30.83 
 
 		 590 aa  179  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  31.77 
 
 		 547 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  32.37 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  31.38 
 
 		 563 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  32.42 
 
 		 547 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  28.51 
 
 		 568 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  30.28 
 
 		 585 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  31.86 
 
 		 547 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  31.86 
 
 		 547 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  31.86 
 
 		 547 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5545  L-lactate transport  33.95 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  30.25 
 
 		 510 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  31.86 
 
 		 547 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  32.49 
 
 		 547 aa  172  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  31.86 
 
 		 547 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  30.28 
 
 		 507 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  30.77 
 
 		 611 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  31.58 
 
 		 548 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  31.58 
 
 		 548 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  32.28 
 
 		 547 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  30.65 
 
 		 623 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  29.75 
 
 		 601 aa  170  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  29.93 
 
 		 550 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  30.83 
 
 		 568 aa  168  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  30.92 
 
 		 547 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  32.52 
 
 		 570 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  29.33 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  29.52 
 
 		 562 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  32.71 
 
 		 570 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  30.09 
 
 		 551 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  31.24 
 
 		 570 aa  163  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  31.63 
 
 		 569 aa  163  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  32.4 
 
 		 516 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  30.49 
 
 		 545 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  32.13 
 
 		 556 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  29.96 
 
 		 561 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  32.51 
 
 		 570 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2811  L-lactate permease  28.83 
 
 		 511 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  29.41 
 
 		 560 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  29.59 
 
 		 557 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  29.15 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  31.2 
 
 		 562 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  30.21 
 
 		 556 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  28.94 
 
 		 551 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  28.94 
 
 		 551 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  28.94 
 
 		 551 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.11 
 
 		 538 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  29.94 
 
 		 556 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  29.41 
 
 		 592 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  27.72 
 
 		 540 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  27.65 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  31.38 
 
 		 563 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  30 
 
 		 556 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  27.03 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  29.75 
 
 		 557 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  29.68 
 
 		 561 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  30 
 
 		 556 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  29.03 
 
 		 552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  30.07 
 
 		 548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000751768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  28.12 
 
 		 552 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  30.31 
 
 		 564 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  28.54 
 
 		 552 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  28.25 
 
 		 543 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  27.65 
 
 		 553 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  28.54 
 
 		 557 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  29.54 
 
 		 560 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  29.54 
 
 		 560 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  29.54 
 
 		 560 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  28.23 
 
 		 539 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000690012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  27.13 
 
 		 539 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  29.54 
 
 		 560 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  29.54 
 
 		 560 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>