262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3564 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2897  L-lactate transport  63.02 
 
 		 576 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  100 
 
 		 566 aa  1110    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  94.52 
 
 		 563 aa  1057    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  94.35 
 
 		 563 aa  1056    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3729  L-lactate transport  85.69 
 
 		 562 aa  919    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0206932  normal  0.436025 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19850  L-lactate transport  55.65 
 
 		 564 aa  575  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17820  L-lactate transport  48.54 
 
 		 559 aa  479  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5545  L-lactate transport  47.87 
 
 		 533 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4802  L-lactate transport  51.17 
 
 		 594 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170237  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4142  L-lactate transport  46.34 
 
 		 581 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  44.31 
 
 		 552 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  45.1 
 
 		 556 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  44.93 
 
 		 554 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  44.92 
 
 		 556 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  45.1 
 
 		 556 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  44.63 
 
 		 556 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  45.29 
 
 		 562 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  44.81 
 
 		 564 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  41.56 
 
 		 553 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  43.34 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  42.83 
 
 		 561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  42.47 
 
 		 545 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  42.96 
 
 		 560 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  41.13 
 
 		 552 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  43.54 
 
 		 557 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  40.93 
 
 		 552 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  42.65 
 
 		 589 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  41.03 
 
 		 553 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  42.96 
 
 		 560 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  42.96 
 
 		 560 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  42.96 
 
 		 560 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  43.14 
 
 		 560 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  42.96 
 
 		 560 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  40.93 
 
 		 553 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  42.6 
 
 		 560 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  40.67 
 
 		 552 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  40.67 
 
 		 552 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  40.67 
 
 		 552 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  41.57 
 
 		 569 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  43.7 
 
 		 561 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  40.67 
 
 		 552 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  41.36 
 
 		 547 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  42.38 
 
 		 569 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  43.14 
 
 		 560 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  40.85 
 
 		 552 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  42.26 
 
 		 576 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  40.07 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  40.18 
 
 		 551 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  41.21 
 
 		 545 aa  395  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  40.18 
 
 		 551 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  40 
 
 		 551 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  40 
 
 		 551 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  39.42 
 
 		 592 aa  392  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  39.61 
 
 		 553 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  42.66 
 
 		 566 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  43.34 
 
 		 566 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  42.63 
 
 		 566 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  43.45 
 
 		 575 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  40.21 
 
 		 551 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  40.38 
 
 		 560 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  40.64 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  40.25 
 
 		 543 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  39 
 
 		 545 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  39.9 
 
 		 558 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  40.21 
 
 		 551 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  40.57 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  40.57 
 
 		 551 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  40.57 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  40.5 
 
 		 551 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  40.57 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  40.57 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  40.57 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  40.57 
 
 		 551 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  40.57 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  40.57 
 
 		 551 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  40.53 
 
 		 572 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  40.18 
 
 		 572 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  40.18 
 
 		 572 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  40.18 
 
 		 572 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  40.18 
 
 		 572 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  40.18 
 
 		 572 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  39.47 
 
 		 552 aa  361  3e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  38.38 
 
 		 553 aa  350  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  37.02 
 
 		 557 aa  349  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  36.97 
 
 		 557 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  39.53 
 
 		 557 aa  348  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  39.17 
 
 		 557 aa  347  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  38.31 
 
 		 558 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1521  L-lactate transport  37.59 
 
 		 532 aa  346  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  0.438189 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3200  L-lactate transport  38.66 
 
 		 546 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  38.16 
 
 		 552 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2060  L-lactate transporter  39.08 
 
 		 549 aa  343  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  37.15 
 
 		 556 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  38.82 
 
 		 553 aa  341  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3085  L-lactate transport  39.26 
 
 		 546 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0103578  normal  0.0137528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1327  L-lactate transport  39.04 
 
 		 554 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1762  L-lactate permease  37.17 
 
 		 578 aa  339  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.68133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  38.82 
 
 		 553 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2534  L-lactate transport  38.91 
 
 		 546 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3147  L-lactate transport  38.91 
 
 		 546 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>