259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17820 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_17820  L-lactate transport  100 
 
 		 559 aa  1108    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19850  L-lactate transport  54.06 
 
 		 564 aa  565  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  48.45 
 
 		 563 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  48.45 
 
 		 563 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  48.19 
 
 		 566 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3729  L-lactate transport  48.19 
 
 		 562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0206932  normal  0.436025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2897  L-lactate transport  47.55 
 
 		 576 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5545  L-lactate transport  42.7 
 
 		 533 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  40.54 
 
 		 545 aa  359  6e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  39.22 
 
 		 592 aa  346  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  37.48 
 
 		 545 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  38.09 
 
 		 556 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  38.09 
 
 		 556 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  37.91 
 
 		 556 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  37.91 
 
 		 556 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4802  L-lactate transport  40.33 
 
 		 594 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  37.05 
 
 		 557 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  38.52 
 
 		 576 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4142  L-lactate transport  36.63 
 
 		 581 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  36.44 
 
 		 553 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  36.51 
 
 		 552 aa  321  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  36.33 
 
 		 552 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  37.85 
 
 		 547 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  36.9 
 
 		 543 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  36.35 
 
 		 552 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  36.77 
 
 		 562 aa  320  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  36.65 
 
 		 553 aa  320  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  36.62 
 
 		 553 aa  320  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  37.04 
 
 		 557 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  36.68 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  36.68 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  36.68 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  38.97 
 
 		 560 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  36.68 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  36.51 
 
 		 560 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  36.51 
 
 		 552 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  36.6 
 
 		 551 aa  316  8e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  36.47 
 
 		 553 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  37.8 
 
 		 558 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  37.44 
 
 		 564 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  36.6 
 
 		 570 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  37.72 
 
 		 566 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  37.07 
 
 		 569 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  36.59 
 
 		 551 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  36.3 
 
 		 551 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  35.82 
 
 		 589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  36.59 
 
 		 551 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  36.59 
 
 		 551 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  36.22 
 
 		 560 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  37.48 
 
 		 569 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  36.22 
 
 		 560 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  36.22 
 
 		 560 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  36.22 
 
 		 560 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  36.22 
 
 		 560 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  37.37 
 
 		 566 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  36.05 
 
 		 560 aa  306  6e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  37.17 
 
 		 561 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  37.44 
 
 		 566 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  35.88 
 
 		 560 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  35.85 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  35.77 
 
 		 554 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  36.47 
 
 		 561 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  36.84 
 
 		 556 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  34.8 
 
 		 545 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  37.24 
 
 		 557 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  36.06 
 
 		 551 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  35.22 
 
 		 572 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  35.89 
 
 		 551 aa  292  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  36.82 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  35.16 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  35.16 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1521  L-lactate transport  34.15 
 
 		 532 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  0.438189 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  35.16 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  35.16 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  35.16 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  35.78 
 
 		 551 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  35.78 
 
 		 551 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  35.78 
 
 		 551 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  35.78 
 
 		 551 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  35.78 
 
 		 551 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  35.78 
 
 		 551 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  35.78 
 
 		 551 aa  290  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  35.78 
 
 		 551 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  35.78 
 
 		 551 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  36.86 
 
 		 575 aa  289  8e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  36.1 
 
 		 552 aa  280  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  37 
 
 		 558 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  35.28 
 
 		 560 aa  280  7e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  35.28 
 
 		 565 aa  279  8e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  33.62 
 
 		 551 aa  279  8e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  35 
 
 		 560 aa  278  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  35.65 
 
 		 555 aa  276  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2060  L-lactate transporter  34.63 
 
 		 549 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  33.97 
 
 		 553 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  34.04 
 
 		 540 aa  274  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  33.62 
 
 		 552 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  34.27 
 
 		 557 aa  270  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3200  L-lactate transport  33.69 
 
 		 546 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6502  L-lactate transporter  33.87 
 
 		 556 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165535  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  33.74 
 
 		 553 aa  266  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>