262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3729 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  85.69 
 
 		 566 aa  949    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3729  L-lactate transport  100 
 
 		 562 aa  1095    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0206932  normal  0.436025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  85.44 
 
 		 563 aa  965    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2897  L-lactate transport  64.24 
 
 		 576 aa  670    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  85.44 
 
 		 563 aa  965    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19850  L-lactate transport  56.92 
 
 		 564 aa  574  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17820  L-lactate transport  48.19 
 
 		 559 aa  482  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5545  L-lactate transport  47.49 
 
 		 533 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4802  L-lactate transport  51 
 
 		 594 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  44.01 
 
 		 552 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  44.32 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  44.32 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  44.14 
 
 		 556 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  44.4 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4142  L-lactate transport  45.22 
 
 		 581 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  45.34 
 
 		 562 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  43.94 
 
 		 545 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  43.68 
 
 		 557 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  45.78 
 
 		 564 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  44.01 
 
 		 554 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  41.4 
 
 		 553 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  43.14 
 
 		 560 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  43.86 
 
 		 561 aa  412  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  41.5 
 
 		 552 aa  412  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  43.35 
 
 		 545 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  40.87 
 
 		 551 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  43.32 
 
 		 560 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  40.87 
 
 		 551 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  41.04 
 
 		 553 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  41.04 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  43.14 
 
 		 560 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  41.22 
 
 		 553 aa  412  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  43.14 
 
 		 560 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  43.14 
 
 		 560 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  44.19 
 
 		 560 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  41.4 
 
 		 552 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  41.04 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  43.14 
 
 		 560 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  42.78 
 
 		 560 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  40.86 
 
 		 552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  40.86 
 
 		 552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  40.86 
 
 		 552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  40.86 
 
 		 552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  42.71 
 
 		 547 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  42.14 
 
 		 570 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  40.68 
 
 		 552 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  42.05 
 
 		 569 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  42.73 
 
 		 561 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  41.04 
 
 		 557 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  41.57 
 
 		 560 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  42.47 
 
 		 566 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  42.19 
 
 		 569 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  42.47 
 
 		 566 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  42.23 
 
 		 576 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  39.57 
 
 		 553 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  43.37 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  41.22 
 
 		 551 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  40.42 
 
 		 543 aa  392  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  41.78 
 
 		 551 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  41.43 
 
 		 551 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  41.43 
 
 		 551 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  41.43 
 
 		 551 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  41.45 
 
 		 589 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  41.43 
 
 		 551 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  40.42 
 
 		 551 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  41.43 
 
 		 551 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  39.38 
 
 		 592 aa  389  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  41.43 
 
 		 551 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  41.43 
 
 		 551 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  41.43 
 
 		 551 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  41.43 
 
 		 551 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  40.22 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  42.47 
 
 		 575 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  40.56 
 
 		 552 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  40.87 
 
 		 558 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  39.22 
 
 		 545 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  40.32 
 
 		 572 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  39.96 
 
 		 572 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  39.96 
 
 		 572 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  39.96 
 
 		 572 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  39.96 
 
 		 572 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  39.96 
 
 		 572 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  39.75 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  40.15 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  39.64 
 
 		 557 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  39.45 
 
 		 557 aa  355  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  39.75 
 
 		 553 aa  353  5e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  39.75 
 
 		 553 aa  350  5e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1327  L-lactate transport  40.82 
 
 		 554 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  37.75 
 
 		 556 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1521  L-lactate transport  37.92 
 
 		 532 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  0.438189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  39.96 
 
 		 555 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4131  L-lactate transport  39.34 
 
 		 554 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.868822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  37.63 
 
 		 557 aa  339  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0640  L-lactate transport  38.83 
 
 		 578 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.391277 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2060  L-lactate transporter  39.37 
 
 		 549 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4740  L-lactate transport  38.68 
 
 		 579 aa  336  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4730  L-lactate transport  39.93 
 
 		 554 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.833176 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3200  L-lactate transport  38.54 
 
 		 546 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1762  L-lactate permease  37.3 
 
 		 578 aa  335  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.68133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>