262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5545 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5545  L-lactate transport  100 
 
 		 533 aa  1029    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  47.17 
 
 		 563 aa  495  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  47 
 
 		 563 aa  494  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  47.98 
 
 		 566 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3729  L-lactate transport  47.49 
 
 		 562 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0206932  normal  0.436025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4802  L-lactate transport  51.43 
 
 		 594 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170237  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4142  L-lactate transport  49.05 
 
 		 581 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2897  L-lactate transport  46.18 
 
 		 576 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19850  L-lactate transport  45.11 
 
 		 564 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  41.46 
 
 		 592 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  41.62 
 
 		 545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  41.11 
 
 		 545 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  40.18 
 
 		 551 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  41.56 
 
 		 556 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  41.17 
 
 		 556 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  40 
 
 		 551 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17820  L-lactate transport  42.35 
 
 		 559 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  40.18 
 
 		 551 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  40 
 
 		 551 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  41.76 
 
 		 557 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  41.56 
 
 		 556 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  41.41 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  41 
 
 		 560 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  41.64 
 
 		 551 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  41.64 
 
 		 551 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  41.64 
 
 		 551 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  41.64 
 
 		 551 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  41.64 
 
 		 551 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  41.64 
 
 		 551 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  41.64 
 
 		 551 aa  382  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  41.49 
 
 		 556 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  40.67 
 
 		 564 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  40.37 
 
 		 547 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  40.56 
 
 		 562 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  39.89 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  41.64 
 
 		 551 aa  382  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  41.64 
 
 		 551 aa  382  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  40.7 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  38.13 
 
 		 576 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  39.31 
 
 		 553 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  39.2 
 
 		 552 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  38.6 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  40.55 
 
 		 551 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  40.29 
 
 		 551 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  39.31 
 
 		 552 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  39.63 
 
 		 543 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  38.84 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  38.84 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  38.84 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  40.99 
 
 		 569 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  38.84 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  38.66 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  38.95 
 
 		 553 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  38.52 
 
 		 553 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  40.88 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  40.29 
 
 		 545 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  41.34 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  40.39 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  40.57 
 
 		 561 aa  369  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  40.04 
 
 		 552 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  37.68 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  41.03 
 
 		 575 aa  369  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  41.16 
 
 		 557 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  39.57 
 
 		 560 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  41.56 
 
 		 566 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  40.21 
 
 		 566 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  40.07 
 
 		 560 aa  364  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  40.07 
 
 		 560 aa  364  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  40.21 
 
 		 566 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  40.07 
 
 		 560 aa  364  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  41.98 
 
 		 558 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  40.07 
 
 		 560 aa  364  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  40.07 
 
 		 560 aa  364  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  40.07 
 
 		 560 aa  364  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  40.81 
 
 		 569 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  39.71 
 
 		 560 aa  360  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  39.19 
 
 		 552 aa  361  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  39.67 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  40.59 
 
 		 553 aa  359  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  39.08 
 
 		 573 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  39.3 
 
 		 553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  41.31 
 
 		 555 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  38.78 
 
 		 589 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  38.83 
 
 		 554 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  39.63 
 
 		 557 aa  351  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  39.63 
 
 		 557 aa  349  6e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  40.57 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1521  L-lactate transport  38.29 
 
 		 532 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  0.438189 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0561  L-lactate transport  37.52 
 
 		 560 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.044221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  38.88 
 
 		 572 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  38.88 
 
 		 572 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  38.88 
 
 		 572 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  39.05 
 
 		 572 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  38.88 
 
 		 572 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  38.88 
 
 		 572 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  37.95 
 
 		 558 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5796  L-lactate transport  38.26 
 
 		 553 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  35.96 
 
 		 539 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  38.19 
 
 		 551 aa  334  3e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  35.96 
 
 		 539 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>