263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3085 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2673  L-lactate transport  68.17 
 
 		 532 aa  661    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1521  L-lactate transport  68.93 
 
 		 532 aa  715    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  0.438189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6502  L-lactate transporter  97.25 
 
 		 556 aa  986    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165535  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2060  L-lactate transporter  85.61 
 
 		 549 aa  914    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1446  L-lactate/H+ symporter  68.17 
 
 		 532 aa  661    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.48388  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2534  L-lactate transport  97.07 
 
 		 546 aa  984    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3085  L-lactate transport  100 
 
 		 546 aa  1058    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0103578  normal  0.0137528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3167  L-lactate transport  97.07 
 
 		 546 aa  983    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95118  hitchhiker  0.00142104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3200  L-lactate transport  99.63 
 
 		 546 aa  1055    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3147  L-lactate transport  97.07 
 
 		 546 aa  984    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3141  L-lactate transport  93.68 
 
 		 554 aa  957    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000030121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  55.9 
 
 		 540 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  42.57 
 
 		 556 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  44.1 
 
 		 557 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  43.38 
 
 		 557 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  41.89 
 
 		 552 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  41.53 
 
 		 552 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  42 
 
 		 553 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  42 
 
 		 553 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  43.04 
 
 		 557 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  41.17 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  41.17 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  41.17 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  41.17 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  43.12 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  41.17 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  40.36 
 
 		 553 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  40.4 
 
 		 553 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  40.95 
 
 		 545 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  40.33 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  40.82 
 
 		 543 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  40.11 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  42.04 
 
 		 558 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  40.93 
 
 		 592 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  41.53 
 
 		 545 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  41.59 
 
 		 552 aa  364  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  42.94 
 
 		 554 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  41.71 
 
 		 589 aa  360  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  41.14 
 
 		 560 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  39.96 
 
 		 560 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  39.78 
 
 		 560 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  39.78 
 
 		 560 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  39.78 
 
 		 560 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  39.78 
 
 		 560 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  39.78 
 
 		 560 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  41.08 
 
 		 551 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  41.08 
 
 		 551 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  40.82 
 
 		 553 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  41.2 
 
 		 557 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  39.42 
 
 		 560 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  40.9 
 
 		 551 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  40.9 
 
 		 551 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  40.19 
 
 		 557 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  41.55 
 
 		 556 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  40.78 
 
 		 573 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  40.86 
 
 		 562 aa  353  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  40.19 
 
 		 557 aa  352  8e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7063  L-lactate transport  40.79 
 
 		 559 aa  352  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0419328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  41.55 
 
 		 556 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  39.31 
 
 		 553 aa  351  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  40.53 
 
 		 563 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  41.84 
 
 		 561 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  40.56 
 
 		 570 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6242  L-lactate transport  40.43 
 
 		 559 aa  350  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  40.35 
 
 		 563 aa  350  5e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  41.16 
 
 		 556 aa  350  6e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  41.16 
 
 		 556 aa  350  6e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  40.83 
 
 		 560 aa  349  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  40.67 
 
 		 558 aa  349  9e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  39.31 
 
 		 553 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  42.07 
 
 		 555 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4131  L-lactate transport  39.59 
 
 		 554 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.868822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  39.68 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  41.84 
 
 		 569 aa  348  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  41.89 
 
 		 552 aa  347  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  39.82 
 
 		 566 aa  347  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0640  L-lactate transport  40.36 
 
 		 578 aa  346  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.391277 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  40.28 
 
 		 572 aa  346  8e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  40.28 
 
 		 572 aa  346  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  40.28 
 
 		 572 aa  346  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  40.28 
 
 		 572 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  41.28 
 
 		 575 aa  345  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  40.28 
 
 		 572 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2353  L-lactate permease  40.79 
 
 		 558 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  40.28 
 
 		 572 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4730  L-lactate transport  40.22 
 
 		 554 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.833176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  37.55 
 
 		 576 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  40.5 
 
 		 564 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0908  L-lactate transport  40.49 
 
 		 558 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00938786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1327  L-lactate transport  39.77 
 
 		 554 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4740  L-lactate transport  38.72 
 
 		 579 aa  340  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  38.98 
 
 		 552 aa  340  5e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  40.25 
 
 		 561 aa  339  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  42.46 
 
 		 566 aa  339  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  40.59 
 
 		 566 aa  339  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  39.01 
 
 		 552 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2515  L-lactate transport  39.75 
 
 		 558 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.419445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  40.42 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0561  L-lactate transport  39.78 
 
 		 560 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.044221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0981  putative L-lactate permease transmembrane protein  39.31 
 
 		 562 aa  337  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175298  normal  0.106183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>