262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2669 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  64.21 
 
 
563 aa  717    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  100 
 
 
570 aa  1100    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  38.03 
 
 
553 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  37.88 
 
 
574 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  37.81 
 
 
575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  37.87 
 
 
562 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  36.96 
 
 
568 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  37.23 
 
 
563 aa  319  7.999999999999999e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  36.55 
 
 
564 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  36.86 
 
 
570 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  35.26 
 
 
570 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  35.94 
 
 
570 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  38.13 
 
 
564 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  35.33 
 
 
568 aa  311  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  34.22 
 
 
564 aa  310  5.9999999999999995e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  36.09 
 
 
582 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  35.5 
 
 
570 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  35.2 
 
 
569 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  36.33 
 
 
590 aa  299  7e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  36.91 
 
 
567 aa  299  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  34.03 
 
 
601 aa  297  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  36.63 
 
 
620 aa  296  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  35.61 
 
 
566 aa  292  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  37.1 
 
 
592 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  35.68 
 
 
566 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  35.28 
 
 
588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  35.33 
 
 
563 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  34.75 
 
 
611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  33.22 
 
 
578 aa  273  9e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  35.64 
 
 
610 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  34.37 
 
 
585 aa  270  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  35.96 
 
 
586 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  33.88 
 
 
585 aa  265  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  33.88 
 
 
585 aa  262  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  31.81 
 
 
623 aa  257  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  34.29 
 
 
547 aa  249  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  33.81 
 
 
547 aa  248  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  33.63 
 
 
547 aa  239  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  33.45 
 
 
547 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  33.1 
 
 
550 aa  236  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  32.92 
 
 
548 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  32.92 
 
 
548 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  33.16 
 
 
547 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  32.92 
 
 
547 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  32.92 
 
 
547 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  33.27 
 
 
547 aa  232  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  34.64 
 
 
557 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  32.92 
 
 
547 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  32.98 
 
 
547 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  32.92 
 
 
547 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  32.3 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.6 
 
 
538 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  29.37 
 
 
534 aa  187  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  26.67 
 
 
559 aa  171  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  26.93 
 
 
530 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  26.88 
 
 
526 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  28.32 
 
 
545 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  28.08 
 
 
545 aa  149  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  29.78 
 
 
560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  29.6 
 
 
560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  29.6 
 
 
560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  29.6 
 
 
560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  29.6 
 
 
560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  29.6 
 
 
560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  28.99 
 
 
556 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  29.14 
 
 
564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  28.99 
 
 
556 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  29.43 
 
 
560 aa  147  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  28.82 
 
 
556 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  28.95 
 
 
566 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  29.15 
 
 
560 aa  146  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  28.67 
 
 
553 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  29.41 
 
 
556 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  28.43 
 
 
570 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  30.68 
 
 
557 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  27.54 
 
 
576 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  28.79 
 
 
566 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  29.38 
 
 
560 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  26.1 
 
 
551 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  28.82 
 
 
552 aa  145  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  28.01 
 
 
553 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  28.42 
 
 
552 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  28.67 
 
 
552 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  28.67 
 
 
552 aa  143  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  28.67 
 
 
552 aa  143  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  28.67 
 
 
552 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  27.93 
 
 
552 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  28.5 
 
 
552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  29.5 
 
 
569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  28.03 
 
 
553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  27.05 
 
 
543 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  27.38 
 
 
552 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  29.5 
 
 
561 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  30.05 
 
 
547 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  27.63 
 
 
553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  28.45 
 
 
569 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  28.21 
 
 
545 aa  136  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  28.25 
 
 
560 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  27.56 
 
 
551 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  27.54 
 
 
551 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>