258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2279 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  64.43 
 
 
586 aa  697    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  100 
 
 
611 aa  1195    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  57.89 
 
 
588 aa  630  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  53.04 
 
 
585 aa  567  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  53.95 
 
 
575 aa  566  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  53.29 
 
 
585 aa  561  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  52.48 
 
 
574 aa  556  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  51.49 
 
 
585 aa  553  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  51.99 
 
 
564 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  49.4 
 
 
564 aa  535  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  51.37 
 
 
601 aa  538  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  51.56 
 
 
566 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  49.57 
 
 
582 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  48.88 
 
 
563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  51.34 
 
 
564 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  51.55 
 
 
592 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  53.63 
 
 
610 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  50.78 
 
 
563 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  48.19 
 
 
568 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  47.84 
 
 
567 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  50.89 
 
 
620 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  44.23 
 
 
623 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  49.65 
 
 
566 aa  487  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  43.42 
 
 
568 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  42.91 
 
 
562 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  42.81 
 
 
547 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  42.61 
 
 
553 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  42.5 
 
 
547 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  42.33 
 
 
547 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  42.5 
 
 
547 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  42.66 
 
 
570 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  42.33 
 
 
548 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  42.33 
 
 
548 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  43.21 
 
 
547 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  42.5 
 
 
547 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  42.5 
 
 
547 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  42.33 
 
 
547 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  42.83 
 
 
570 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  42.26 
 
 
550 aa  392  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  41.8 
 
 
547 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  42.08 
 
 
547 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  42.71 
 
 
569 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  41.45 
 
 
547 aa  389  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  42.14 
 
 
590 aa  387  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  41.74 
 
 
570 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  40.67 
 
 
578 aa  379  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  40.91 
 
 
570 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  42.15 
 
 
557 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.29 
 
 
538 aa  347  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  34.75 
 
 
570 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  32.65 
 
 
563 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  34.15 
 
 
511 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  30.87 
 
 
559 aa  223  6e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  32.02 
 
 
526 aa  210  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  29.43 
 
 
534 aa  199  7.999999999999999e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  29.84 
 
 
530 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  29.74 
 
 
544 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  29.86 
 
 
545 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  26.22 
 
 
500 aa  180  9e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  29.79 
 
 
551 aa  178  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  32.36 
 
 
548 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  29.17 
 
 
566 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  30.77 
 
 
446 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  28.2 
 
 
563 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  27.58 
 
 
565 aa  162  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  28.2 
 
 
563 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  28.11 
 
 
543 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  27.58 
 
 
560 aa  162  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  28.19 
 
 
553 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  27.93 
 
 
552 aa  161  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  28.43 
 
 
552 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  29.05 
 
 
552 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  28.22 
 
 
553 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  28.29 
 
 
553 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  28.62 
 
 
545 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  26.46 
 
 
560 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  28.16 
 
 
558 aa  157  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  28.06 
 
 
551 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  28.06 
 
 
551 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  27.93 
 
 
552 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  27.93 
 
 
552 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  27.93 
 
 
552 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  27.89 
 
 
551 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  27.93 
 
 
552 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  27.89 
 
 
551 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  28.99 
 
 
547 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  27.8 
 
 
552 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  24.04 
 
 
516 aa  154  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  25.74 
 
 
551 aa  153  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  25.43 
 
 
592 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  27.67 
 
 
562 aa  151  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  26.62 
 
 
545 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  27.05 
 
 
557 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  27.3 
 
 
556 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  27.3 
 
 
556 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  27.3 
 
 
556 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  27.52 
 
 
553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  27.32 
 
 
556 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1340  L-lactate permease  27.81 
 
 
516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  26.89 
 
 
556 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>