261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0208 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  100 
 
 		 590 aa  1142    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  50.87 
 
 		 578 aa  512  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  41.03 
 
 		 564 aa  415  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  41.68 
 
 		 568 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  39.76 
 
 		 564 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  41.35 
 
 		 588 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  41.3 
 
 		 570 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  42.35 
 
 		 611 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  40.27 
 
 		 568 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  41.84 
 
 		 553 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  40.17 
 
 		 563 aa  395  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  39.36 
 
 		 585 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  39.49 
 
 		 582 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  41.58 
 
 		 574 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  41.21 
 
 		 575 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  38.69 
 
 		 570 aa  389  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  39.04 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  40.5 
 
 		 564 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  39.76 
 
 		 585 aa  383  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  40.97 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  39.29 
 
 		 563 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  40 
 
 		 562 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  38.87 
 
 		 567 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  41.16 
 
 		 586 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  39.69 
 
 		 585 aa  376  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  38.89 
 
 		 569 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  40.25 
 
 		 620 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  38.09 
 
 		 570 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  39.79 
 
 		 601 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  39.35 
 
 		 566 aa  369  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  39.35 
 
 		 566 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  41.97 
 
 		 592 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  37.91 
 
 		 547 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  37.5 
 
 		 623 aa  339  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  36.27 
 
 		 547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  36.28 
 
 		 547 aa  320  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  36.78 
 
 		 548 aa  320  6e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  36.78 
 
 		 548 aa  320  6e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  36.59 
 
 		 547 aa  320  7e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  37.37 
 
 		 547 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  36.14 
 
 		 550 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  36.08 
 
 		 547 aa  316  8e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  36.64 
 
 		 547 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  36.44 
 
 		 547 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  36.08 
 
 		 547 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  36.08 
 
 		 547 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  36.08 
 
 		 547 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  35.2 
 
 		 570 aa  297  4e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  34.94 
 
 		 563 aa  295  1e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  33.97 
 
 		 557 aa  291  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.36 
 
 		 538 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  25.65 
 
 		 534 aa  187  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  28.92 
 
 		 511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  28.99 
 
 		 526 aa  182  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  28.26 
 
 		 559 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  27.26 
 
 		 570 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  27.93 
 
 		 545 aa  167  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  27.63 
 
 		 530 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  28.25 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  27.26 
 
 		 566 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  28.33 
 
 		 564 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  28.1 
 
 		 557 aa  157  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  27.07 
 
 		 566 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  26.84 
 
 		 565 aa  156  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  26.84 
 
 		 560 aa  156  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  27.67 
 
 		 543 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  26.32 
 
 		 553 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  27.61 
 
 		 560 aa  154  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  26.58 
 
 		 569 aa  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  27.77 
 
 		 589 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  26.36 
 
 		 553 aa  150  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  27.32 
 
 		 561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  27.46 
 
 		 557 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  24.71 
 
 		 592 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  26.73 
 
 		 553 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  27.65 
 
 		 558 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  25.38 
 
 		 553 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  26.32 
 
 		 551 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  26.32 
 
 		 551 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  25.79 
 
 		 552 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  26.13 
 
 		 551 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  26.13 
 
 		 551 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  27.99 
 
 		 545 aa  146  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  25.61 
 
 		 552 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  27.46 
 
 		 557 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  25.47 
 
 		 553 aa  143  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  27.93 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  26.23 
 
 		 544 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5796  L-lactate transport  26.3 
 
 		 553 aa  141  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  26.4 
 
 		 553 aa  140  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  26.4 
 
 		 553 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  24.41 
 
 		 552 aa  140  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  27.04 
 
 		 552 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0561  L-lactate transport  25.5 
 
 		 560 aa  137  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.044221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2428  L-lactate transport  26.37 
 
 		 584 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  26.12 
 
 		 500 aa  136  9.999999999999999e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2209  putative L-lactate permease transmembrane protein  25 
 
 		 553 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.771798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  27.22 
 
 		 558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  27.61 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  24.86 
 
 		 561 aa  135  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>