259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0708 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  64.42 
 
 		 534 aa  686    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  100 
 
 		 559 aa  1082    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  60.65 
 
 		 526 aa  624  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  43.51 
 
 		 530 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  42.56 
 
 		 544 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  34.28 
 
 		 553 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  32.22 
 
 		 588 aa  234  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  32.77 
 
 		 585 aa  229  8e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  32.96 
 
 		 568 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  33.33 
 
 		 585 aa  224  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  33.33 
 
 		 585 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  31.07 
 
 		 611 aa  221  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  31.24 
 
 		 586 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  33.07 
 
 		 570 aa  210  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  30.32 
 
 		 601 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  32.17 
 
 		 570 aa  205  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  31.63 
 
 		 575 aa  200  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  31.79 
 
 		 582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  30.55 
 
 		 610 aa  196  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  32.94 
 
 		 569 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  30.76 
 
 		 574 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  31.62 
 
 		 563 aa  194  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  30.27 
 
 		 511 aa  193  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  29.02 
 
 		 550 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  29.6 
 
 		 564 aa  189  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  29.38 
 
 		 547 aa  189  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  29.81 
 
 		 547 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  29.81 
 
 		 547 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  29.81 
 
 		 547 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  29.81 
 
 		 547 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  29.17 
 
 		 562 aa  188  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  32.87 
 
 		 570 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  31.01 
 
 		 620 aa  187  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  29.81 
 
 		 547 aa  186  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  29.33 
 
 		 547 aa  186  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  29.93 
 
 		 548 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  29.93 
 
 		 548 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  30.94 
 
 		 592 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  30.09 
 
 		 547 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  29.51 
 
 		 547 aa  183  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.37 
 
 		 538 aa  183  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  30.09 
 
 		 564 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  28.62 
 
 		 547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  28.79 
 
 		 567 aa  181  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  29.35 
 
 		 547 aa  181  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  29.53 
 
 		 578 aa  179  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  30.32 
 
 		 570 aa  177  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  29.37 
 
 		 564 aa  177  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  29.64 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  29.86 
 
 		 568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  28.44 
 
 		 590 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  27.92 
 
 		 623 aa  171  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  29.88 
 
 		 566 aa  170  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  31.41 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48999  LCTP l-lactate permease  34.89 
 
 		 689 aa  167  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  26.53 
 
 		 570 aa  166  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  30.86 
 
 		 563 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  26.57 
 
 		 563 aa  157  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  28.69 
 
 		 446 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  26.39 
 
 		 560 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  26.18 
 
 		 560 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  26.18 
 
 		 565 aa  124  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  24.5 
 
 		 551 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  24.31 
 
 		 551 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  24.5 
 
 		 551 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  24.5 
 
 		 551 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  26.76 
 
 		 556 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  28.78 
 
 		 552 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  25.43 
 
 		 539 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  25.11 
 
 		 539 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  25.11 
 
 		 539 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3939  L-lactate transport  25.2 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  26.56 
 
 		 556 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  26.56 
 
 		 556 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  26.56 
 
 		 556 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  26.96 
 
 		 504 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  24.31 
 
 		 551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  28.21 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  24.31 
 
 		 551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  26.24 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  24.31 
 
 		 551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  25.35 
 
 		 564 aa  115  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  27.23 
 
 		 552 aa  115  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  24.31 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  24.31 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  24.31 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  24.31 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  24.31 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  24.31 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  24.84 
 
 		 539 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  24.67 
 
 		 551 aa  114  6e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  24.84 
 
 		 539 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  24.84 
 
 		 539 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  24.84 
 
 		 539 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  26.78 
 
 		 545 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  24.14 
 
 		 516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2209  putative L-lactate permease transmembrane protein  26.96 
 
 		 553 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.771798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  24.8 
 
 		 561 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  24.5 
 
 		 551 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  22.04 
 
 		 500 aa  109  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>