259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2994 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  100 
 
 		 548 aa  1035    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  48.75 
 
 		 446 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  45.32 
 
 		 504 aa  325  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  46.76 
 
 		 494 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  34.65 
 
 		 564 aa  231  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  34.12 
 
 		 588 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  32.26 
 
 		 568 aa  213  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  32.55 
 
 		 563 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  33.57 
 
 		 574 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  30.76 
 
 		 564 aa  210  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  32.62 
 
 		 575 aa  209  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  31.54 
 
 		 582 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  34.55 
 
 		 511 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  32.68 
 
 		 564 aa  203  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  33.39 
 
 		 563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  33.81 
 
 		 566 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  31.74 
 
 		 620 aa  200  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  32.41 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  32.56 
 
 		 611 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  34.36 
 
 		 507 aa  192  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  32.01 
 
 		 562 aa  191  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  34.04 
 
 		 586 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  30.52 
 
 		 585 aa  189  9e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  31.58 
 
 		 570 aa  188  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  33.49 
 
 		 506 aa  187  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  31.78 
 
 		 547 aa  187  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  31.12 
 
 		 585 aa  187  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  33.56 
 
 		 506 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.6 
 
 		 538 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  34.29 
 
 		 610 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  31.14 
 
 		 592 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  27.08 
 
 		 623 aa  183  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  32.68 
 
 		 570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  32.03 
 
 		 567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  31.67 
 
 		 570 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  30.28 
 
 		 547 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  30.1 
 
 		 585 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  30.87 
 
 		 547 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  31.24 
 
 		 547 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  32.41 
 
 		 506 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  31.24 
 
 		 547 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  31.24 
 
 		 547 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  31.19 
 
 		 569 aa  177  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  31.24 
 
 		 547 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  30.38 
 
 		 547 aa  176  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  31.46 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  31.11 
 
 		 547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  29.2 
 
 		 601 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  30.51 
 
 		 548 aa  173  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  30.51 
 
 		 548 aa  173  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  32.75 
 
 		 578 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  31.1 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  29.24 
 
 		 510 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  29.68 
 
 		 550 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  31.44 
 
 		 570 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  31.11 
 
 		 547 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  29.4 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  31.3 
 
 		 526 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  30 
 
 		 568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  29.03 
 
 		 560 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  29.45 
 
 		 543 aa  158  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  29.19 
 
 		 557 aa  156  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  27.5 
 
 		 576 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  27.62 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  28.82 
 
 		 557 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  27.72 
 
 		 556 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  27.72 
 
 		 556 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  28.38 
 
 		 556 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  27.5 
 
 		 556 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  30.91 
 
 		 563 aa  150  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  27.88 
 
 		 551 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  27.88 
 
 		 551 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  27.03 
 
 		 539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000690012  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  28.14 
 
 		 590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  27.66 
 
 		 539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  27.51 
 
 		 551 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  26.77 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  27.22 
 
 		 539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  27.85 
 
 		 557 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  27.7 
 
 		 551 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  28.6 
 
 		 564 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  27.22 
 
 		 539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  27.4 
 
 		 566 aa  148  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  30.86 
 
 		 552 aa  148  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  27.05 
 
 		 563 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  28.35 
 
 		 545 aa  147  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  27.05 
 
 		 563 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  25.94 
 
 		 534 aa  146  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  26.03 
 
 		 539 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  26.03 
 
 		 539 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  26.03 
 
 		 539 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  29.78 
 
 		 545 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  26.67 
 
 		 559 aa  144  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  26.92 
 
 		 552 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  25.56 
 
 		 539 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  27.26 
 
 		 551 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  25.56 
 
 		 539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  26.26 
 
 		 552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  25.56 
 
 		 539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  25.56 
 
 		 539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>