258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3391 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  57.64 
 
 
601 aa  653    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  100 
 
 
623 aa  1225    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  47.09 
 
 
574 aa  498  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  47.26 
 
 
575 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  47.15 
 
 
564 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  44.23 
 
 
611 aa  482  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  47.17 
 
 
564 aa  485  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  48.21 
 
 
588 aa  480  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  48.34 
 
 
610 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  47.26 
 
 
566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  43.99 
 
 
563 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  45.33 
 
 
620 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  43.3 
 
 
582 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  45.93 
 
 
563 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  46.23 
 
 
586 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  42.07 
 
 
568 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  44.96 
 
 
564 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  46.64 
 
 
585 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  45.83 
 
 
566 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  44.68 
 
 
567 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  44.67 
 
 
585 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  45.38 
 
 
592 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  46.3 
 
 
585 aa  435  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  41.84 
 
 
562 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  41.31 
 
 
568 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  41.34 
 
 
570 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  41.09 
 
 
570 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  40.93 
 
 
553 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  40.85 
 
 
547 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  41.77 
 
 
570 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  40.52 
 
 
570 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  41.65 
 
 
547 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  39.51 
 
 
548 aa  362  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  39.51 
 
 
548 aa  362  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  39.34 
 
 
569 aa  361  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  39.58 
 
 
547 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  39.58 
 
 
547 aa  360  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  40.03 
 
 
547 aa  360  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  39.58 
 
 
547 aa  360  5e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  39.58 
 
 
547 aa  360  5e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  41.48 
 
 
547 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  40 
 
 
550 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  38.84 
 
 
547 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  39.17 
 
 
547 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  38.99 
 
 
547 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  39.31 
 
 
557 aa  330  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  37.14 
 
 
590 aa  323  6e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  36.64 
 
 
578 aa  317  5e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.68 
 
 
538 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  31.81 
 
 
570 aa  249  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  31.72 
 
 
563 aa  243  6e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  28.39 
 
 
511 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  29.22 
 
 
534 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  29.24 
 
 
526 aa  180  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  27.64 
 
 
530 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  27.92 
 
 
559 aa  171  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  26.48 
 
 
500 aa  158  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  25.95 
 
 
510 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  28.67 
 
 
544 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  26.08 
 
 
507 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  28.43 
 
 
446 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  26.45 
 
 
548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  26.93 
 
 
506 aa  144  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  26.75 
 
 
507 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  26.93 
 
 
506 aa  140  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2897  L-lactate transport  25.16 
 
 
576 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  24.26 
 
 
516 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  25.09 
 
 
566 aa  135  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  25.33 
 
 
557 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  26.72 
 
 
586 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  25.47 
 
 
563 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  26.89 
 
 
545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  25.47 
 
 
563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  27.16 
 
 
494 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  26.82 
 
 
561 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  25.9 
 
 
558 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  25.42 
 
 
551 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  25.25 
 
 
551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  25.08 
 
 
551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  27.52 
 
 
506 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  24.96 
 
 
592 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  25.08 
 
 
551 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_002950  PG1340  L-lactate permease  26.18 
 
 
516 aa  128  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  24.76 
 
 
556 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  25.65 
 
 
552 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  26.45 
 
 
548 aa  127  8.000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000751768  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  25.08 
 
 
552 aa  127  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4730  L-lactate transport  26.52 
 
 
554 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.833176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  25.65 
 
 
545 aa  124  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  25.66 
 
 
540 aa  124  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  25.17 
 
 
553 aa  124  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4131  L-lactate transport  25.38 
 
 
554 aa  123  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.868822  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  25.58 
 
 
552 aa  123  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  25.13 
 
 
553 aa  121  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  25.59 
 
 
565 aa  121  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  25.64 
 
 
551 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  25.59 
 
 
560 aa  121  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  25.24 
 
 
557 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  25.25 
 
 
553 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1521  L-lactate transport  24.91 
 
 
532 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  0.438189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>