262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  64.57 
 
 		 610 aa  655    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  100 
 
 		 592 aa  1139    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  53.1 
 
 		 574 aa  558  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  53.45 
 
 		 575 aa  557  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  56.39 
 
 		 586 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  52.53 
 
 		 611 aa  551  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  54.9 
 
 		 588 aa  547  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  49.73 
 
 		 564 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  50.84 
 
 		 601 aa  533  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  50.45 
 
 		 582 aa  526  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  50.09 
 
 		 563 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  49.65 
 
 		 568 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  50.63 
 
 		 563 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  49.19 
 
 		 564 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  51.28 
 
 		 567 aa  514  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  52.24 
 
 		 620 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  51.48 
 
 		 564 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  48.49 
 
 		 585 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  50.36 
 
 		 566 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  50.81 
 
 		 585 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  49.39 
 
 		 585 aa  483  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  45.5 
 
 		 623 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  48.57 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  43.36 
 
 		 568 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  44.93 
 
 		 547 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  45.08 
 
 		 562 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  44.3 
 
 		 553 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  44.81 
 
 		 547 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  42.91 
 
 		 570 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  44.16 
 
 		 548 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  44.16 
 
 		 548 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  43.77 
 
 		 547 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  44.57 
 
 		 547 aa  405  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  43.43 
 
 		 547 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  43.43 
 
 		 547 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  43.25 
 
 		 570 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  43.43 
 
 		 547 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  43.9 
 
 		 547 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  44.99 
 
 		 547 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  43.43 
 
 		 547 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  42.81 
 
 		 569 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  43.17 
 
 		 570 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  42.81 
 
 		 578 aa  396  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  42.11 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  42.7 
 
 		 547 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  43.35 
 
 		 570 aa  395  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  42 
 
 		 590 aa  392  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  43.5 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.75 
 
 		 538 aa  355  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  37.08 
 
 		 570 aa  323  5e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  36.83 
 
 		 563 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  35.83 
 
 		 511 aa  286  7e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  32.1 
 
 		 526 aa  217  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  30.86 
 
 		 559 aa  213  7e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  30.46 
 
 		 530 aa  210  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  29.71 
 
 		 534 aa  207  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  34.3 
 
 		 446 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  33.46 
 
 		 494 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  31.94 
 
 		 544 aa  182  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  25.36 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  30.66 
 
 		 548 aa  167  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  28.96 
 
 		 545 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  30.59 
 
 		 504 aa  161  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  26.98 
 
 		 589 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  28.42 
 
 		 506 aa  158  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  26.28 
 
 		 507 aa  156  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  28.2 
 
 		 545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  27.08 
 
 		 556 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  27.08 
 
 		 556 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  26.9 
 
 		 556 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  26.96 
 
 		 556 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  26.53 
 
 		 556 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  26.6 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  27.27 
 
 		 557 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  26.45 
 
 		 592 aa  142  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  26.65 
 
 		 551 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  26.65 
 
 		 551 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  26.65 
 
 		 551 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  27.36 
 
 		 506 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1957  L-lactate permease  27.05 
 
 		 533 aa  140  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  26.46 
 
 		 565 aa  140  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  26.47 
 
 		 551 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  29.85 
 
 		 564 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  26.74 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  22.91 
 
 		 510 aa  140  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  26.46 
 
 		 560 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  27.08 
 
 		 551 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2436  L-lactate transport  27.02 
 
 		 532 aa  139  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2390  L-lactate transport  27.02 
 
 		 532 aa  139  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  28.57 
 
 		 557 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  25.53 
 
 		 576 aa  138  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  26.39 
 
 		 552 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  26.62 
 
 		 545 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  26.1 
 
 		 553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  27.78 
 
 		 540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  25.27 
 
 		 553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3939  L-lactate transport  26.97 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  26.19 
 
 		 560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  27.16 
 
 		 560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  27.42 
 
 		 562 aa  135  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>