263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0307 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  100 
 
 		 510 aa  979    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  97.63 
 
 		 507 aa  900    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  54.31 
 
 		 506 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  53.01 
 
 		 506 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  53.12 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  51 
 
 		 507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  47.81 
 
 		 516 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  46.72 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2676  L-lactate transport  47.43 
 
 		 517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1785  L-lactate transport  46.23 
 
 		 516 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1340  L-lactate permease  40.78 
 
 		 516 aa  330  4e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  36.93 
 
 		 545 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  36.13 
 
 		 552 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  35.94 
 
 		 552 aa  306  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  36.24 
 
 		 592 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  35.5 
 
 		 553 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  35.75 
 
 		 552 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  35.32 
 
 		 553 aa  302  9e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  36.95 
 
 		 556 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  36.76 
 
 		 556 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  35.57 
 
 		 552 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  35.57 
 
 		 552 aa  302  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  35.57 
 
 		 552 aa  302  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  35.57 
 
 		 552 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  36.76 
 
 		 556 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  35.32 
 
 		 553 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  36.57 
 
 		 556 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3939  L-lactate transport  39.3 
 
 		 515 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  35.32 
 
 		 553 aa  298  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  36.48 
 
 		 561 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  36.89 
 
 		 552 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  35.98 
 
 		 562 aa  294  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  36.5 
 
 		 560 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  36.5 
 
 		 560 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  36.5 
 
 		 560 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  36.5 
 
 		 560 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  36.5 
 
 		 560 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  36.5 
 
 		 560 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  35.36 
 
 		 560 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  36.5 
 
 		 560 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  37.81 
 
 		 565 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  37.81 
 
 		 560 aa  290  6e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  36.38 
 
 		 575 aa  289  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  33.4 
 
 		 551 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  36.02 
 
 		 564 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  35.55 
 
 		 576 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  33.21 
 
 		 551 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  35.14 
 
 		 557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  35 
 
 		 560 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  33.02 
 
 		 551 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  33.02 
 
 		 551 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  36.93 
 
 		 560 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  34.55 
 
 		 545 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  34.33 
 
 		 547 aa  279  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  32.84 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  34.19 
 
 		 557 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  32.84 
 
 		 569 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  34.14 
 
 		 561 aa  272  8.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  32.47 
 
 		 573 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  33.59 
 
 		 543 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  33.52 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  33.08 
 
 		 551 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  33.46 
 
 		 566 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  34.08 
 
 		 552 aa  269  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  33.21 
 
 		 556 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  34.54 
 
 		 539 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  33.27 
 
 		 566 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  34.24 
 
 		 545 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  34.48 
 
 		 539 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  34.38 
 
 		 563 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  32.1 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  36.38 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  34.38 
 
 		 563 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  31.91 
 
 		 572 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  31.91 
 
 		 572 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  31.91 
 
 		 572 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  31.91 
 
 		 572 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  33.02 
 
 		 551 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  34.35 
 
 		 539 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  34.6 
 
 		 589 aa  263  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  31.73 
 
 		 572 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  34.16 
 
 		 539 aa  263  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  31.73 
 
 		 572 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0490  L-lactate transport  34.02 
 
 		 541 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  32.9 
 
 		 566 aa  261  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  32.28 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  33.78 
 
 		 539 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  33.78 
 
 		 539 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  32.28 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  32.28 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  32.28 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  32.28 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  32.28 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  32.28 
 
 		 551 aa  259  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  32.28 
 
 		 551 aa  259  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  32.28 
 
 		 551 aa  259  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  32.9 
 
 		 566 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  34.54 
 
 		 558 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  33.52 
 
 		 552 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  33.71 
 
 		 539 aa  257  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>