264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0970 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  84.92 
 
 
506 aa  837    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  83.27 
 
 
506 aa  788    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  100 
 
 
506 aa  996    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  53.14 
 
 
510 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  52.3 
 
 
507 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  44.6 
 
 
500 aa  412  1e-114  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  46.06 
 
 
507 aa  395  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  43.87 
 
 
516 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2676  L-lactate transport  45.04 
 
 
517 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1785  L-lactate transport  45.44 
 
 
516 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1340  L-lactate permease  38.68 
 
 
516 aa  342  8e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  37.45 
 
 
592 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  36.26 
 
 
545 aa  289  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  36.21 
 
 
545 aa  281  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3939  L-lactate transport  35.94 
 
 
515 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  37 
 
 
552 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  36.07 
 
 
557 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  34.08 
 
 
553 aa  276  8e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  35.81 
 
 
589 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  33.96 
 
 
552 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  35.45 
 
 
545 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  35.53 
 
 
576 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  33.46 
 
 
552 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  33.71 
 
 
553 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  34.5 
 
 
556 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  34.52 
 
 
552 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  34.52 
 
 
552 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  34.52 
 
 
552 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  34.52 
 
 
552 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  34.32 
 
 
556 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  33.15 
 
 
553 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  34.32 
 
 
556 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  33.77 
 
 
553 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  34.33 
 
 
552 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  37.5 
 
 
575 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  33.78 
 
 
565 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  33.78 
 
 
560 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  34.85 
 
 
543 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  34.4 
 
 
556 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  35.37 
 
 
560 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  35.05 
 
 
551 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  35.55 
 
 
557 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  33.46 
 
 
560 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  34.57 
 
 
564 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  35.46 
 
 
561 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  32.95 
 
 
551 aa  261  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  34.58 
 
 
560 aa  261  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  34.71 
 
 
560 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  34.71 
 
 
560 aa  260  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  34.71 
 
 
560 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  34.71 
 
 
560 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  34.71 
 
 
560 aa  260  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  34.74 
 
 
551 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  34.74 
 
 
551 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  34.71 
 
 
560 aa  259  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  35.15 
 
 
547 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  36.75 
 
 
554 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  34.55 
 
 
551 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  34.55 
 
 
551 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  35.33 
 
 
539 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  34 
 
 
573 aa  257  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  34.62 
 
 
539 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  35.13 
 
 
539 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  35.7 
 
 
539 aa  256  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  34.78 
 
 
560 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  34.25 
 
 
539 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  33.72 
 
 
562 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  34.25 
 
 
539 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  34.44 
 
 
539 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  34.44 
 
 
539 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  34.24 
 
 
539 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  33.88 
 
 
572 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  35.14 
 
 
539 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000690012  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  33.88 
 
 
572 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  33.88 
 
 
572 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  34.18 
 
 
572 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  33.88 
 
 
572 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  34.94 
 
 
558 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  33.88 
 
 
572 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  33.33 
 
 
570 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  34.24 
 
 
539 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  33.15 
 
 
569 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  34.02 
 
 
561 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  33.72 
 
 
551 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  33.4 
 
 
556 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  32.52 
 
 
566 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  32.52 
 
 
566 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0149  glycolate permease GlcA  34.78 
 
 
531 aa  242  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  34.1 
 
 
551 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  32 
 
 
552 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  33.89 
 
 
561 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  33.84 
 
 
563 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  33.84 
 
 
563 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2209  putative L-lactate permease transmembrane protein  34.23 
 
 
553 aa  240  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.771798 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  34.49 
 
 
551 aa  240  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  33.78 
 
 
557 aa  240  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  34.49 
 
 
551 aa  240  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  34.49 
 
 
551 aa  240  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  33.78 
 
 
557 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2544  L-lactate transport  34.4 
 
 
555 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>