260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1340 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1340  L-lactate permease  100 
 
 		 516 aa  998    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  38.68 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  38.95 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  37.48 
 
 		 516 aa  336  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  42.73 
 
 		 510 aa  335  9e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  42.29 
 
 		 507 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  40.79 
 
 		 500 aa  327  4.0000000000000003e-88  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  41.22 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2676  L-lactate transport  39.2 
 
 		 517 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  37.07 
 
 		 507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1785  L-lactate transport  41.39 
 
 		 516 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3939  L-lactate transport  34.4 
 
 		 515 aa  266  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  32.84 
 
 		 592 aa  239  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  32.6 
 
 		 552 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  33.46 
 
 		 556 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  33.46 
 
 		 556 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  32.72 
 
 		 553 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  33.09 
 
 		 589 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  33.46 
 
 		 556 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  32.36 
 
 		 560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  32.42 
 
 		 552 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  32.36 
 
 		 560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  31.34 
 
 		 553 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  32.36 
 
 		 560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  32.36 
 
 		 560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  33.46 
 
 		 556 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  32.36 
 
 		 560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  32.36 
 
 		 560 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  30.98 
 
 		 553 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  31.61 
 
 		 545 aa  233  6e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  31.34 
 
 		 553 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  32.18 
 
 		 560 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  32.42 
 
 		 552 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  32.23 
 
 		 552 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  32.23 
 
 		 552 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  32.23 
 
 		 552 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  32.23 
 
 		 552 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  33.47 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  30.62 
 
 		 576 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  31.17 
 
 		 545 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  30.77 
 
 		 560 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  32.61 
 
 		 564 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  31.23 
 
 		 562 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  31.92 
 
 		 557 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  30.76 
 
 		 557 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  34.59 
 
 		 543 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  31.83 
 
 		 561 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  31.84 
 
 		 545 aa  219  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  30.32 
 
 		 573 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  31.78 
 
 		 551 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  31.78 
 
 		 551 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  31.84 
 
 		 551 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  31.78 
 
 		 551 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  30.59 
 
 		 566 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  30.76 
 
 		 563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  30.76 
 
 		 563 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  32.65 
 
 		 547 aa  213  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  32.51 
 
 		 561 aa  213  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  32.25 
 
 		 565 aa  213  9e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  29.72 
 
 		 539 aa  213  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4350  L-lactate transport  34.22 
 
 		 561 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  32.25 
 
 		 560 aa  213  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  29.53 
 
 		 539 aa  212  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  29.96 
 
 		 572 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  29.35 
 
 		 539 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  31.26 
 
 		 551 aa  210  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0097  L-lactate transport  32.58 
 
 		 530 aa  209  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0101  L-lactate transport  32.58 
 
 		 530 aa  209  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  31.69 
 
 		 566 aa  209  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  29.86 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  29.86 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  31.19 
 
 		 570 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  29.86 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  29.86 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  29.86 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  29.16 
 
 		 539 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  29.24 
 
 		 539 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  29.16 
 
 		 539 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0490  L-lactate transport  31.43 
 
 		 541 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  29.16 
 
 		 539 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000280788  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4131  L-lactate transport  30.84 
 
 		 554 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.868822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  29.71 
 
 		 569 aa  207  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  28.97 
 
 		 539 aa  206  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000214943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  30.55 
 
 		 575 aa  206  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  33.39 
 
 		 552 aa  206  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  30.61 
 
 		 586 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  31.7 
 
 		 560 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  31.83 
 
 		 556 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5796  L-lactate transport  31.28 
 
 		 553 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  29.41 
 
 		 553 aa  205  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  33.84 
 
 		 554 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0720  L-lactate permease  30.56 
 
 		 557 aa  204  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0710  L-lactate permease  30.56 
 
 		 557 aa  204  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  28.52 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000954326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  28.52 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298254  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  29.74 
 
 		 553 aa  204  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1327  L-lactate transport  30.04 
 
 		 554 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  29.67 
 
 		 552 aa  203  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  30.42 
 
 		 551 aa  202  8e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  29.23 
 
 		 553 aa  202  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>