259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2686 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  65.49 
 
 
620 aa  696    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  62.54 
 
 
575 aa  696    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  65.96 
 
 
564 aa  767    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  65.9 
 
 
564 aa  758    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  63.59 
 
 
563 aa  721    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  65.01 
 
 
566 aa  720    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  63.7 
 
 
582 aa  716    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  100 
 
 
564 aa  1098    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  76.2 
 
 
566 aa  838    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  64.01 
 
 
567 aa  745    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  63.59 
 
 
568 aa  720    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  68.74 
 
 
563 aa  754    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  61.84 
 
 
574 aa  694    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  50.36 
 
 
601 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  50.95 
 
 
611 aa  524  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  50.73 
 
 
588 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  52.33 
 
 
586 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  46.86 
 
 
585 aa  474  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  47.3 
 
 
585 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  48.82 
 
 
610 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  44.6 
 
 
623 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  51.19 
 
 
592 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  47.4 
 
 
585 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  44.61 
 
 
553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  43.72 
 
 
568 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  43.58 
 
 
547 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  43.09 
 
 
548 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  43.09 
 
 
548 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  43.45 
 
 
547 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  43.45 
 
 
547 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  43.45 
 
 
547 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  44 
 
 
547 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  42.91 
 
 
547 aa  422  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  43.45 
 
 
547 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  43.82 
 
 
547 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  43.09 
 
 
547 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  43.45 
 
 
562 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  42.13 
 
 
547 aa  415  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  42.73 
 
 
547 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  44.55 
 
 
570 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  42.58 
 
 
570 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  42.86 
 
 
550 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  42.59 
 
 
569 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  42.52 
 
 
557 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  41.61 
 
 
578 aa  401  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  42.75 
 
 
570 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  43.44 
 
 
570 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  40.5 
 
 
590 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.96 
 
 
538 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  38.05 
 
 
570 aa  319  7e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  33.51 
 
 
563 aa  295  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  34.13 
 
 
511 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  34.45 
 
 
548 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  31.85 
 
 
526 aa  196  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  29.77 
 
 
534 aa  195  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  30.16 
 
 
446 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  29.9 
 
 
559 aa  192  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  29.25 
 
 
530 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  29.16 
 
 
504 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  29.81 
 
 
544 aa  174  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  27.73 
 
 
545 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  27.68 
 
 
553 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  27.34 
 
 
553 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  26.77 
 
 
543 aa  171  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  27.83 
 
 
552 aa  170  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  27.83 
 
 
552 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  27.83 
 
 
552 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  27.83 
 
 
552 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  27.83 
 
 
552 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  27.34 
 
 
553 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  28 
 
 
552 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  27.65 
 
 
551 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  27.65 
 
 
551 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  27.65 
 
 
551 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  27.65 
 
 
551 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  31.69 
 
 
494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  27.82 
 
 
556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  27.82 
 
 
556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  27.46 
 
 
552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  27.47 
 
 
556 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  29.16 
 
 
540 aa  164  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  27.24 
 
 
506 aa  163  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  27.1 
 
 
565 aa  162  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  27.27 
 
 
551 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  27.59 
 
 
547 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  24.66 
 
 
592 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  26.63 
 
 
576 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  27.1 
 
 
560 aa  161  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  26.43 
 
 
500 aa  161  4e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  27.65 
 
 
556 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  26.6 
 
 
551 aa  160  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  26.6 
 
 
551 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  26.6 
 
 
551 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  26.6 
 
 
551 aa  160  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  26.6 
 
 
551 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  26.6 
 
 
551 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  26.6 
 
 
551 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  26.6 
 
 
551 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  26.6 
 
 
551 aa  160  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  27.2 
 
 
560 aa  160  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>