260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1396 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  100 
 
 		 511 aa  974    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  34.13 
 
 		 568 aa  269  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  35.47 
 
 		 620 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  34.19 
 
 		 582 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  34.15 
 
 		 611 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  33.64 
 
 		 563 aa  260  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  35.73 
 
 		 592 aa  259  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  34.14 
 
 		 564 aa  259  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  32.91 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  32.85 
 
 		 575 aa  258  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  31.62 
 
 		 564 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  34.01 
 
 		 547 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  32.96 
 
 		 547 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  32.16 
 
 		 547 aa  250  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  32.84 
 
 		 547 aa  250  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  32.66 
 
 		 563 aa  250  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  33.02 
 
 		 547 aa  249  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  32.96 
 
 		 547 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  32.96 
 
 		 547 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  32.96 
 
 		 547 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  32.16 
 
 		 547 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  32.29 
 
 		 548 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  32.29 
 
 		 548 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  31.61 
 
 		 547 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  32.59 
 
 		 550 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  33.09 
 
 		 564 aa  243  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  32.91 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  33.21 
 
 		 567 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  33.76 
 
 		 566 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  31.14 
 
 		 601 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  31.72 
 
 		 547 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.97 
 
 		 538 aa  237  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  34.07 
 
 		 566 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  34.25 
 
 		 562 aa  233  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  31.63 
 
 		 585 aa  232  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  32.85 
 
 		 588 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  34.09 
 
 		 553 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  35.34 
 
 		 586 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  32.85 
 
 		 568 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  34.37 
 
 		 570 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  31.93 
 
 		 570 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  31.09 
 
 		 610 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  32.23 
 
 		 570 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  30.63 
 
 		 585 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  31.43 
 
 		 569 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  32.38 
 
 		 570 aa  217  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  32.28 
 
 		 563 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  30.34 
 
 		 585 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  32.3 
 
 		 570 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  28.39 
 
 		 623 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  33.27 
 
 		 526 aa  201  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  29.68 
 
 		 534 aa  196  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  30.4 
 
 		 578 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  30.27 
 
 		 559 aa  194  5e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  30.57 
 
 		 510 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  34.55 
 
 		 548 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  29.64 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  29.57 
 
 		 506 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  28.98 
 
 		 590 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  32.44 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  29.15 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  29.75 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  29.81 
 
 		 504 aa  160  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  28.36 
 
 		 552 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  28.23 
 
 		 553 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  28.39 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  29.54 
 
 		 506 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  26.07 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  27.72 
 
 		 552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  27.74 
 
 		 552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  27.74 
 
 		 552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  27.74 
 
 		 552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  27.74 
 
 		 552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  27.55 
 
 		 552 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  27.49 
 
 		 553 aa  153  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  27.57 
 
 		 507 aa  151  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  28.36 
 
 		 545 aa  150  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  28.82 
 
 		 551 aa  149  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  33.75 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  29.62 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  28.25 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  28.25 
 
 		 563 aa  148  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  27.99 
 
 		 569 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  28.06 
 
 		 556 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  27.83 
 
 		 589 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  28.22 
 
 		 557 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  29.08 
 
 		 575 aa  145  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  27.5 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  27.5 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  27.47 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  26.59 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000751768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  27.32 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  28.35 
 
 		 576 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  27.31 
 
 		 556 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  27.93 
 
 		 544 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  27.29 
 
 		 561 aa  144  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  27.95 
 
 		 560 aa  144  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  26.78 
 
 		 553 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  28.17 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  27.99 
 
 		 569 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>